252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0836 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  100 
 
 
446 aa  871    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 
433 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2119  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91986  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.54 
 
 
452 aa  77  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  23.06 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.06 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.95 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  21.23 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.17 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.61 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 
449 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2977  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  22.45 
 
 
443 aa  60.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  22.78 
 
 
442 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 
435 aa  60.5  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  24.5 
 
 
470 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  20.16 
 
 
459 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 
464 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27.73 
 
 
565 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.05 
 
 
436 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 
972 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.23 
 
 
451 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  26.29 
 
 
483 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  20.71 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.42 
 
 
576 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.93 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  19.61 
 
 
462 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.93 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.93 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  20.11 
 
 
443 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.58 
 
 
484 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  27.63 
 
 
472 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  18.86 
 
 
1496 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  19.09 
 
 
440 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 
525 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  25 
 
 
463 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 
488 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.43 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  19.04 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1523  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 
472 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993843  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  18.54 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  18.54 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  23.79 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  19.71 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 
425 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.36 
 
 
494 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.98 
 
 
452 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  20.35 
 
 
462 aa  53.5  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  30 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.59 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.59 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.83 
 
 
489 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 
470 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  18.27 
 
 
485 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  20.75 
 
 
438 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.84 
 
 
465 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.19 
 
 
428 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.28 
 
 
428 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  21.43 
 
 
451 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  19.11 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0142  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
440 aa  51.2  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  20.55 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  19.26 
 
 
437 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.56 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  22.12 
 
 
494 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  19.95 
 
 
471 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 
467 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  20 
 
 
469 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  21.83 
 
 
489 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 
578 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.85 
 
 
479 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.5 
 
 
483 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 
578 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1581  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 
454 aa  50.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
472 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1561  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  23.95 
 
 
480 aa  50.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 
441 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  24.27 
 
 
444 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3396  Outer membrane protein-like protein  25.59 
 
 
414 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  19 
 
 
441 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.14 
 
 
446 aa  50.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.3 
 
 
480 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 
627 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  21.62 
 
 
489 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  21.62 
 
 
489 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  21.62 
 
 
489 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.85 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  22.63 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.11 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.68 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.85 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 
476 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  21.24 
 
 
493 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2529  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.75 
 
 
485 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>