More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2977 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2977  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 454 aa  858    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  62.77 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1523  outer membrane efflux protein  37.97 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2119  outer membrane efflux protein  36.43 
 
 		 478 aa  130  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91986  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  30.02 
 
 		 576 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.85 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.17 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.85 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.38 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.84 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.84 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.84 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2896  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.11 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  29.17 
 
 		 738 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.38 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.98 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.57 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.87 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  27.53 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.9 
 
 		 627 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.4 
 
 		 443 aa  67  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  27.8 
 
 		 497 aa  67  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  26.52 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  25.62 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.55 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.02 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.19 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  32.71 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  24.29 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.48 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  30.63 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.72 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.22 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.09 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  28.15 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.85 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  26.09 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  30.91 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.7 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2011  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.37 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0256922 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  25.57 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.81 
 
 		 1470 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  24.84 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  30.91 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  25.84 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.05 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.82 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0019  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.62 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  26.91 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.15 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222051  normal  0.460518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.83 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.77 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  25.86 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  25.86 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.86 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  25.86 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3473  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.61 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0809824  normal  0.12883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.83 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.56 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  25.86 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.61 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.95 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  25.86 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.04 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  27.04 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  25.86 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.38 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  25.86 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  25.45 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  25.13 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  28.01 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  25.9 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  31.29 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.41 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>