63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1523 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1523  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 472 aa  884    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  36.67 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2977  outer membrane efflux protein  37.86 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2119  outer membrane efflux protein  37.5 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91986  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  27.22 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  29.09 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.02 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.18 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.42 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0733  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.07 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 1496 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2245  outer membrane efflux protein  35.71 
 
 		 333 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.593421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.86 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 500 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  27.78 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  26.21 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.85 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1495  outer membrane efflux protein  26.92 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.74284  normal  0.017078 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  27.58 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 738 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.3 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.17 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.48 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.56 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  29.63 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  28.01 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2380  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.81 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  28.03 
 
 		 489 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.36 
 
 		 465 aa  47  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  28.92 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  28.92 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.62 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.65 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  32.19 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  28.92 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3453  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.96 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.47 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.36 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.81 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.62 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.67 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  24.61 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  26.63 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 528 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.36 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.98 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.16 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  26.04 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.5 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  26.06 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 460 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  28.48 
 
 		 394 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>