34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2245 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2245  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 333 aa  626  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.593421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  65.68 
 
 		 333 aa  327  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  35.21 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1063  outer membrane efflux protein  34.06 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1524  hypothetical protein  33.12 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24819  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2118  hypothetical protein  30.82 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470052  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  32.47 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.54 
 
 		 485 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2194  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.4 
 
 		 518 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0247365  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.3 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.77 
 
 		 485 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.01 
 
 		 455 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 501 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.17 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  30.77 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.91 
 
 		 483 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  37.01 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.37 
 
 		 445 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  30.71 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.15 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  30.71 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  30.71 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.69 
 
 		 486 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.69 
 
 		 486 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4008  outer membrane protein oprM  28.8 
 
 		 468 aa  43.5  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  30.71 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6346  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.47 
 
 		 491 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.62 
 
 		 544 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.65 
 
 		 452 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.8 
 
 		 468 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3584  outer membrane protein oprM  28.8 
 
 		 468 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 446 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  30.15 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>