53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1496 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 333 aa  633  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2245  outer membrane efflux protein  64.62 
 
 		 333 aa  332  8e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.593421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  35.1 
 
 		 352 aa  119  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  28.78 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1063  outer membrane efflux protein  30.67 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2118  hypothetical protein  32.59 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470052  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0800  outer membrane efflux protein  31.69 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1524  hypothetical protein  31.19 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24819  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1495  outer membrane efflux protein  32.51 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.74284  normal  0.017078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.02 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.62 
 
 		 444 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.62 
 
 		 444 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.03 
 
 		 525 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.22 
 
 		 450 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  34.75 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 569 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.8 
 
 		 450 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.58 
 
 		 532 aa  48.9  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2342  Outer membrane protein-like  24.6 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4152  Outer membrane protein-like protein  26.14 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000101728  hitchhiker  0.00000035562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  31.9 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 		 507 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 		 507 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2582  hypothetical protein  24.82 
 
 		 520 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.37 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.97 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0165  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.58 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1840  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.72 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.37883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  31.01 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2436  hypothetical protein  24.09 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2841  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.86 
 
 		 482 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2529  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.79 
 
 		 485 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.97 
 
 		 511 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.19 
 
 		 494 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.49 
 
 		 482 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  31.47 
 
 		 503 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.05 
 
 		 443 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.01 
 
 		 505 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.5 
 
 		 533 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.568762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2244  outer membrane efflux protein  30.04 
 
 		 420 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.61 
 
 		 464 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.57 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4008  outer membrane protein oprM  29.73 
 
 		 468 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 507 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.94 
 
 		 470 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.64 
 
 		 501 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.94 
 
 		 500 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.56 
 
 		 515 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 		 510 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0477  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.12 
 
 		 471 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.18 
 
 		 486 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  36.36 
 
 		 528 aa  42.7  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.66 
 
 		 507 aa  42.7  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>