9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0800 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0800  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 336 aa  632  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  30.98 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2245  outer membrane efflux protein  30.37 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.593421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1524  hypothetical protein  31.09 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24819  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1063  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 		 348 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  34.38 
 
 		 472 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2118  hypothetical protein  35.06 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470052  normal  0.883427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>