10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1524 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24819  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1063  outer membrane efflux protein  47.06 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  46.22 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2118  hypothetical protein  45.48 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470052  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2245  outer membrane efflux protein  32.52 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.593421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 415 aa  42.7  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2238  outer membrane efflux protein  28.87 
 
 		 440 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0800  outer membrane efflux protein  30.16 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>