151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2976 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  100 
 
 
352 aa  670    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1063  outer membrane efflux protein  77.74 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2118  hypothetical protein  48.61 
 
 
345 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470052  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1524  hypothetical protein  46.2 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24819  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  33.63 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  34.52 
 
 
333 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2245  outer membrane efflux protein  35.01 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.593421  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0800  outer membrane efflux protein  32.1 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  33.13 
 
 
443 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.33 
 
 
482 aa  63.9  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  27.12 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.68 
 
 
472 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.69 
 
 
495 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4152  Outer membrane protein-like protein  28.29 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000101728  hitchhiker  0.00000035562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.42 
 
 
466 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953441  normal  0.0124942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  31.62 
 
 
635 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4319  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.34 
 
 
483 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.239033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.24 
 
 
546 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.19 
 
 
482 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.95 
 
 
511 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.63 
 
 
498 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.51 
 
 
476 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.6 
 
 
498 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  34.48 
 
 
972 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.6 
 
 
498 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.6 
 
 
498 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.63 
 
 
498 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3630  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.68 
 
 
480 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844951  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.36 
 
 
493 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.63 
 
 
498 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  29.25 
 
 
489 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.37 
 
 
472 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5484  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.22 
 
 
484 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0165  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.78 
 
 
477 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.88 
 
 
537 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
488 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  28.57 
 
 
479 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 
500 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.78 
 
 
488 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.78 
 
 
488 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.69 
 
 
469 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.78 
 
 
533 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.06 
 
 
486 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2363  chemiosmotic efflux system B protein C  25.41 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  30.77 
 
 
731 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.53 
 
 
539 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  25.54 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.8 
 
 
478 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  0.585091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  30.82 
 
 
499 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4977  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.4 
 
 
476 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.14 
 
 
497 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.14 
 
 
486 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 
488 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.62 
 
 
474 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.91 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2977  outer membrane efflux protein  38.81 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 
423 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.49 
 
 
478 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6990  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.3 
 
 
479 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0598431  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.2 
 
 
502 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 
495 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.4 
 
 
465 aa  47  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.26 
 
 
478 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00759632  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4610  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.57 
 
 
480 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3753  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 
480 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.26 
 
 
478 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3770  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 
480 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0658463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.87 
 
 
465 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.25 
 
 
508 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  27.12 
 
 
451 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  32.08 
 
 
578 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  32.08 
 
 
578 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.56 
 
 
527 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.65 
 
 
491 aa  46.6  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.73 
 
 
497 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.94 
 
 
702 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2346  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.15 
 
 
478 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.04 
 
 
472 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 
498 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 
493 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 
498 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2864  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.28 
 
 
468 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0383351  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.71 
 
 
504 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 
498 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 
498 aa  46.2  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  37.21 
 
 
413 aa  46.2  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.78 
 
 
487 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.56 
 
 
514 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  30.93 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.75 
 
 
502 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1142  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.61 
 
 
492 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258577  normal  0.581397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.73 
 
 
472 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1702  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.21 
 
 
521 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  29.56 
 
 
498 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.15 
 
 
495 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 
514 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.49 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.93 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30 
 
 
477 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  30.7 
 
 
438 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>