23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2118 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2118  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  644    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470052  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  48.61 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1063  outer membrane efflux protein  47.73 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1524  hypothetical protein  45.87 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24819  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  28.45 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  31.25 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2245  outer membrane efflux protein  31.1 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.593421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0800  outer membrane efflux protein  31.78 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.94 
 
 		 476 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 		 1991 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.71 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1523  outer membrane efflux protein  29.62 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.993843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3605  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.07 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00599235  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  31.16 
 
 		 635 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2977  outer membrane efflux protein  40.38 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.48 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2041  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.9 
 
 		 511 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1666  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.41 
 
 		 546 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.13 
 
 		 498 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.13 
 
 		 498 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.9 
 
 		 481 aa  42.7  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>