More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6360 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  97.49 
 
 
478 aa  821    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  0.585091 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6360  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
478 aa  912    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  100 
 
 
478 aa  912    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00759632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4966  RND efflux system outer membrane lipoprotein  74.35 
 
 
466 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.953441  normal  0.0124942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.98 
 
 
521 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4865  RND cation/multidrug efflux system outer membrane protein, NodT  39.5 
 
 
493 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000716421  normal  0.820676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2070  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.72 
 
 
498 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633642  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.84 
 
 
499 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00474819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.47 
 
 
500 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.3 
 
 
476 aa  228  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 
495 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.71 
 
 
516 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.33 
 
 
482 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.97 
 
 
487 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.68 
 
 
495 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2104  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.48 
 
 
510 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.77 
 
 
470 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4291  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 
503 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4075  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.29 
 
 
503 aa  210  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147604  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0851  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.93 
 
 
537 aa  209  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238751  hitchhiker  0.00377502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4536  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  36.7 
 
 
533 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748568  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.52 
 
 
474 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3226  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.07 
 
 
503 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303935  normal  0.0862047 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5123  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.34 
 
 
510 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4314  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.06 
 
 
502 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1464  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.87 
 
 
510 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4652  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.6 
 
 
464 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  34.53 
 
 
483 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  33.33 
 
 
508 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1842  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.87 
 
 
510 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0418  outer membrane efflux protein OprC  37.87 
 
 
510 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0829  outer membrane efflux protein OprC  37.87 
 
 
510 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2146  outer membrane efflux protein OprC  37.87 
 
 
510 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0515  outer membrane efflux protein OprC  37.87 
 
 
510 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.52 
 
 
484 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  34.27 
 
 
470 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.52 
 
 
484 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4293  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.27 
 
 
501 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4181  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.27 
 
 
501 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366543  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  37.89 
 
 
508 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.48 
 
 
500 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4333  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.59 
 
 
510 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.0805194 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4223  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.59 
 
 
510 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00337155  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.62 
 
 
472 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1728  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.16 
 
 
509 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141114  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.45 
 
 
497 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5874  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.98 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109065  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.7 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4187  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.95 
 
 
504 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164619  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2098  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.99 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.66 
 
 
473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.49 
 
 
489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.83 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.53 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.45 
 
 
488 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  30.15 
 
 
490 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0908  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.03 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1968  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.77 
 
 
471 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000949064  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 
493 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0566  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.12 
 
 
521 aa  199  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.03 
 
 
482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.24 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.54 
 
 
486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  32.25 
 
 
496 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.39 
 
 
469 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.22 
 
 
486 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7210  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.29 
 
 
486 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.03 
 
 
496 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  29 
 
 
460 aa  195  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.82 
 
 
496 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.27 
 
 
495 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5881  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.81 
 
 
497 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6326  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.09 
 
 
514 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.167129  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1794  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.54 
 
 
486 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1741  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.17 
 
 
514 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259166  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1503  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.09 
 
 
514 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274386  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4697  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.27 
 
 
513 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  0.315368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.32 
 
 
504 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3375  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.24 
 
 
517 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0151483  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  31.01 
 
 
479 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  30.45 
 
 
499 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  31.97 
 
 
497 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.33 
 
 
488 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4619  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.33 
 
 
488 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.573778  normal  0.397239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  34.19 
 
 
475 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.49 
 
 
503 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570974  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.61 
 
 
511 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.8 
 
 
516 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  31.61 
 
 
479 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31 
 
 
482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.37 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  30.09 
 
 
498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.47 
 
 
470 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5685  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.34 
 
 
488 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.166803 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5986  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.74 
 
 
497 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  29.3 
 
 
474 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.75 
 
 
500 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.21 
 
 
485 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  33.26 
 
 
506 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  33.26 
 
 
508 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>