35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1495 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1495  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 442 aa  855    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.74284  normal  0.017078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2244  outer membrane efflux protein  58.16 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.44 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.44 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.44 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.44 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.44 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.14 
 
 		 479 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.79 
 
 		 465 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.84 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  31.8 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.84 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  26.89 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  27.57 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.78 
 
 		 504 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.49 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.31 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.91 
 
 		 552 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26 
 
 		 514 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3940  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.200003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  28.19 
 
 		 466 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.3 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 		 972 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.58 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.94 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.94 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.4 
 
 		 529 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.16 
 
 		 543 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.25 
 
 		 499 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 569 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.19723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>