27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2244 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2244  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 420 aa  803    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.718112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1495  outer membrane efflux protein  58.16 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.74284  normal  0.017078 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  31.56 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 446 aa  57  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  27.65 
 
 		 514 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4412  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.15 
 
 		 484 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.92 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.92 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.85 
 
 		 514 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3940  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 462 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.200003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.12 
 
 		 514 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.51 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6156  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.48 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.23 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.42 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4765  outer membrane efflux protein  28.25 
 
 		 485 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.55701 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6550  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.17 
 
 		 561 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.39 
 
 		 503 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 466 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2483  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.19 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.65 
 
 		 491 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1281  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.17 
 
 		 561 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.183207  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 453 aa  43.1  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.05 
 
 		 466 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>