More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1172 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1172  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3375  HxlR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0302921  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1784  HxlR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1803  HxlR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0896859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1850  HxlR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1805  HxlR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11742  hypothetical protein  36.11 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000021692  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4912  helix-turn-helix, HxlR type  33.33 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1947  transcriptional regulator, HxlR family  29.81 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1948  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2081  transcriptional regulator, HxlR family  27.52 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.325161  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1519  HxlR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  24.54 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2008  transcriptional regulator, HxlR family  29.82 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  37.07 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  40.4 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6277  transcriptional regulator, HxlR family  39.47 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2744  transcriptional regulator, HxlR family  35 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2856  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000163729  normal  0.0358536 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  40.4 
 
 		 178 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  40.4 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3230  HxlR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3457  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00952714  hitchhiker  0.00869506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 148 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4850  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.856766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0626  helix-turn-helix HxlR type  39.58 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 148 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3973  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.0339732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3959  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4033  HxlR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6216  HxlR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350312 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1219  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000243781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  38 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0446  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.560088  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  30.85 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0825  putative transcriptional regulator  39.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.661456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  34.58 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3957  HxlR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  36.17 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  35 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2191  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  30.77 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0502  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 167 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.531787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 147 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  36.84 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6863  HxlR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  35.11 
 
 		 107 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0633  HxlR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 114 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  32.26 
 
 		 118 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0527  HxlR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.640649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  35.48 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  37.63 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  29.7 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  37.63 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  37.63 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  37.63 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  37.63 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  37.63 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  31.11 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1347  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  35.64 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  34 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 120 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  33.05 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0221  transcriptional regulator, HxlR family  29.79 
 
 		 106 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 119 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 129 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  34.41 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2549  HxlR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>