More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2442 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  424  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  46.12 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  48.26 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  44.22 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  45.15 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  43.2 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 192 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  40.29 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  36.99 
 
 		 220 aa  104  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  37.13 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 213 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 212 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  38.92 
 
 		 219 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.47 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 289 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0297  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  32.54 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 247 aa  85.1  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  27.32 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0292  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000945067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>