More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1196 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1196  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 228 aa  437  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185208  hitchhiker  0.000709934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0011  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 249 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  36.05 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  37.05 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  35.55 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  35.85 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  36.41 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  34.33 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.43 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  37.23 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  38.6 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  25.99 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  39.27 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  30.04 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  34.47 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.16 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.97 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  36.42 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0277  regulatory protein GntR HTH  51.16 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  33.84 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.33 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  32.47 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  32.06 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  36.57 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.34 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  30.67 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  35.87 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  31.14 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.49 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  37.72 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.73 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  33.51 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  37.91 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  37.5 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  33.02 
 
 		 223 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  34.88 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  37.82 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  37.35 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  34.34 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  31.4 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  26.11 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.13 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.97 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  28.25 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  35.8 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  31.9 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  36.31 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0357  regulatory protein GntR HTH  32.2 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5646  regulatory protein GntR HTH  28.28 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  30.6 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  31.12 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  33.13 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  40.74 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  40.74 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  36.36 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  40.74 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.81 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2617  regulatory protein GntR HTH  27.41 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.61 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  35.71 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.07 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  29.49 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  38.75 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  33.52 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  28.4 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  29.91 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>