More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10503 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  32.75 
 
 
261 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  38.24 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 
227 aa  89  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  34.8 
 
 
240 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.43 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.33 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.2 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.63 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  31.28 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.55 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.09 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.09 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  27.56 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  33.55 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.1 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.31 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  29.31 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  29.31 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.31 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.31 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  28.1 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.31 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  32.14 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  29.31 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  34.03 
 
 
277 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.31 
 
 
257 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.71 
 
 
240 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  31.46 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  25.66 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  40.65 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  37.8 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2748  fatty acid metabolism regulator  35.71 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  decreased coverage  0.0000363622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.47 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  31.7 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  31.7 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2109  fatty acid metabolism regulator  34.21 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2363  fatty acid metabolism regulator  34.21 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000339682  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  41.67 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1999  fatty acid metabolism regulator  34.21 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00814717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  42.28 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  31.7 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  31.7 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  34.81 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  31.7 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  30.83 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.95 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  30.63 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5646  regulatory protein GntR HTH  33.79 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  30.63 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  30.63 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.31 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  30.63 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  30.63 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.88 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  35.81 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0011  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  29.07 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  29.2 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.99 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.99 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.99 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.99 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  28.99 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  29.78 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  29.41 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>