More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10597 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  66.09 
 
 		 240 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  66.09 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  66.09 
 
 		 239 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0011  GntR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  51.3 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  41.81 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 233 aa  95.1  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.4 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  32 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  31.35 
 
 		 261 aa  85.5  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1196  regulatory protein GntR HTH  35.29 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185208  hitchhiker  0.000709934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0277  regulatory protein GntR HTH  49.5 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  37.78 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  36.05 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0357  regulatory protein GntR HTH  30.73 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  35.2 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  31.16 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  32.29 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  35.27 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  34.72 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  39.23 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01148  fatty acid metabolism regulator  32.52 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0433911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1490  fatty acid metabolism regulator  26.96 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.4 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  38.76 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2130  regulatory protein GntR HTH  27.52 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0857174  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.14 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2087  fatty acid responsive transcription factor FadR domain protein  27.06 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30946e-19 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2885  fatty acid metabolism regulator  32.53 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  28.33 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  39.13 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  29.74 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  35.51 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.54 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1568  fatty acid metabolism regulator  32.53 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1643  fatty acid metabolism regulator  32.53 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000083399  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1635  fatty acid metabolism regulator  32.53 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000615714  normal  0.0628183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  28.16 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2794  fatty acid metabolism regulator  31.12 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00556903  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  42.47 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.63 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  45.45 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2617  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3488  fatty acid metabolism regulator  30.29 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00186982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2147  fatty acid metabolism regulator  28.14 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1683  fatty acid metabolism regulator  30.95 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  45.33 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  30.8 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0114  regulatory protein GntR HTH  33.9 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  45.33 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  45.33 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  45.33 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  27.62 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0623  fatty acid metabolism regulator  26.77 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000168386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  30.4 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  28.51 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1924  fatty acid metabolism regulator  30.67 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000876108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  35.64 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2507  fatty acid metabolism regulator  31.33 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2748  fatty acid metabolism regulator  28.22 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  decreased coverage  0.0000363622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  44.59 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1635  fatty acid metabolism regulator  30.12 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000115144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1778  fatty acid metabolism regulator  31.33 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000719025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1815  fatty acid metabolism regulator  31.33 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1771  fatty acid metabolism regulator  31.33 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000343571  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  35.64 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  30.29 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  30.04 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  31.42 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  45.45 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002979  transcriptional regulator for fatty acid degradation FadR GntR family  28.68 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  25.81 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  40.5 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2438  fatty acid metabolism regulator  30.77 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  28.44 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  31.48 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  30 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02929  fatty acid metabolism regulator  30.58 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  27.43 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  44.59 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  31.06 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>