More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0114 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0114  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  27.75 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  44.74 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  46.48 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0774  regulatory protein GntR HTH  35.71 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.12 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  47.89 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4717  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4432  regulatory protein GntR HTH  38.24 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4733  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0525  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4496  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4331  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4343  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3286  regulatory protein GntR HTH  38.24 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4728  transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4847  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  29.1 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  31.52 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  32.42 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4712  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.09 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  44.62 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  26.09 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  27.02 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  35 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  50 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  30 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  28.63 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  37.35 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  28.63 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  28.63 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  24.47 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  28.23 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  24.65 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  41.38 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1196  regulatory protein GntR HTH  36 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185208  hitchhiker  0.000709934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  28.23 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  28.23 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  46.58 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  32.09 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  25.82 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  28.23 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1635  fatty acid metabolism regulator  25.95 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000615714  normal  0.0628183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  45.71 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1683  fatty acid metabolism regulator  26.4 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  28 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  27.31 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1635  fatty acid metabolism regulator  25.54 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000115144  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  45.31 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  27.18 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  45.28 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  44.64 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  28.23 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  48.08 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  41.18 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  28.82 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1771  fatty acid metabolism regulator  26.11 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000343571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  26.42 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  28.23 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1815  fatty acid metabolism regulator  26.11 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  45.31 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1778  fatty acid metabolism regulator  26.11 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000719025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2507  fatty acid metabolism regulator  26.11 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  25.61 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  41.54 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1643  fatty acid metabolism regulator  26.4 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000083399  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  48.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>