More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5646 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010180  BcerKBAB4_5646  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0357  regulatory protein GntR HTH  37.67 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2438  fatty acid metabolism regulator  36.32 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2087  fatty acid responsive transcription factor FadR domain protein  35.07 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30946e-19 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1635  fatty acid metabolism regulator  35.85 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000115144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2130  regulatory protein GntR HTH  35.44 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0857174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1771  fatty acid metabolism regulator  36.02 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000343571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2507  fatty acid metabolism regulator  36.02 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000437817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1815  fatty acid metabolism regulator  36.02 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.682144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1778  fatty acid metabolism regulator  36.02 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000719025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1924  fatty acid metabolism regulator  35.35 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000876108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2794  fatty acid metabolism regulator  34.9 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00556903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2617  regulatory protein GntR HTH  32.57 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2885  fatty acid metabolism regulator  34.6 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1643  fatty acid metabolism regulator  34.6 
 
 		 241 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000083399  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1743  fatty acid metabolism regulator  34.43 
 
 		 239 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1683  fatty acid metabolism regulator  34.6 
 
 		 238 aa  134  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1568  fatty acid metabolism regulator  34.6 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1635  fatty acid metabolism regulator  34.6 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000615714  normal  0.0628183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2174  fatty acid metabolism regulator  36.96 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  0.0239474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3488  fatty acid metabolism regulator  35.81 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00186982  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0623  fatty acid metabolism regulator  30.99 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000168386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2512  fatty acid metabolism regulator  35.64 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal  0.579868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2689  fatty acid metabolism regulator  35.11 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449481  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1948  fatty acid metabolism regulator  36.96 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00527579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2244  fatty acid metabolism regulator  36.96 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0118438  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1983  fatty acid metabolism regulator  31.75 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199399  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2365  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000203201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1999  fatty acid metabolism regulator  34.24 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00814717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2363  fatty acid metabolism regulator  34.24 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000339682  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2109  fatty acid metabolism regulator  34.24 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109018  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1328  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2003  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1943  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0247778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2003  fatty acid metabolism regulator  32.23 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000120819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1513  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1947  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0438592  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01162  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000799515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2461  fatty acid metabolism transcriptional regulator FadR  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000004944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2438  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01172  hypothetical protein  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000480756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1962  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000133841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1674  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1332  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1290  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1345  fatty acid metabolism regulator  30.56 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01148  fatty acid metabolism regulator  32.81 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0433911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2748  fatty acid metabolism regulator  33.7 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  decreased coverage  0.0000363622 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1661  fatty acid metabolism regulator  28.83 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0855025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002979  transcriptional regulator for fatty acid degradation FadR GntR family  26.92 
 
 		 279 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1490  fatty acid metabolism regulator  28.24 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2147  fatty acid metabolism regulator  27.97 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102966  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02929  fatty acid metabolism regulator  25.77 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  45 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  42 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0277  regulatory protein GntR HTH  35.92 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  27.71 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  33.9 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  43.9 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1561  regulatory protein GntR HTH  29.56 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000597737  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2626  transcriptional regulator PdhR  43 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  27.78 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  39 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  26.83 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  28.37 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  42.57 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  30.39 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  26.61 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  42.57 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  30.39 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  40 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  41.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5900  GntR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.540308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  28.33 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  27.89 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  28.33 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  28.33 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  28.33 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  28.33 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  28.33 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>