150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0154 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  48.9 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  35.23 
 
 		 226 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 269 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 342 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 221 aa  117  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  36.56 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  34.04 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 207 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  45.92 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  28.66 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  17.88 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3676  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508637  decreased coverage  0.00105541 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 424 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0676  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>