240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1373 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1373  ipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 364 aa  717    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  84.07 
 
 		 364 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0314  ipid-A-disaccharide synthase  84.62 
 
 		 364 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1683  ipid-A-disaccharide synthase  83.52 
 
 		 364 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0568935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1652  ipid-A-disaccharide synthase  55.8 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000716832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1311  ipid-A-disaccharide synthase  56.75 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1576  ipid-A-disaccharide synthase  56.15 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0326  ipid-A-disaccharide synthase  55.99 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0200  lipid-A-disaccharide synthase  49.58 
 
 		 343 aa  311  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0903  ipid-A-disaccharide synthase  44.75 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  35.23 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  30.11 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  31.67 
 
 		 402 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 380 aa  155  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  29.94 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  27.98 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  34.65 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  28.95 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  28.11 
 
 		 368 aa  150  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  29.08 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  31.93 
 
 		 384 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  28.45 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  28.87 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.07 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  25.51 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  26.69 
 
 		 384 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  30 
 
 		 383 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2141  lipid-A-disaccharide synthase  25.29 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.14 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  25.07 
 
 		 386 aa  144  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  29.76 
 
 		 380 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  25.91 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  32.28 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  29.08 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  29.08 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  29.24 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  27.62 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  27.51 
 
 		 407 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  27.81 
 
 		 384 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  32.06 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  28.85 
 
 		 379 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  26.43 
 
 		 397 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  25.28 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  26.27 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  25.36 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  27.11 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  27.35 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  27.82 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  26.18 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  26.75 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  28.09 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  26.84 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  26.22 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  28.61 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  27.92 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  29.69 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  30.7 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  32.65 
 
 		 372 aa  133  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  28.49 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  28.93 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  26.67 
 
 		 392 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  25.83 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  29.3 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  26.97 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  31.59 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  26.65 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  28.2 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3148  lipid-A-disaccharide synthase  29.65 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029536  normal  0.0540886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  27.6 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  29.48 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  28.06 
 
 		 410 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  28.03 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  26.35 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  26.35 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  26.41 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  27.38 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  25.22 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.36 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  28.57 
 
 		 377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  29.48 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  27.87 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  28.96 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  25.61 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  30.42 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  25.9 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  26.61 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  27.93 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  32.24 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  29.48 
 
 		 398 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  26.52 
 
 		 396 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  29.48 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  26.37 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  29.39 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  30.15 
 
 		 368 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  26.42 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  25.66 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  30.24 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>