More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3713 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  100 
 
 
182 aa  359  1e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  68.95 
 
 
205 aa  248  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  65.43 
 
 
206 aa  231  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  73.61 
 
 
174 aa  206  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  66.24 
 
 
158 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 
182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  65.33 
 
 
219 aa  187  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 
166 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  60.78 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  58.87 
 
 
430 aa  169  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  57.25 
 
 
258 aa  161  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  55.7 
 
 
160 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  58.74 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 
282 aa  141  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 
272 aa  140  9e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
302 aa  138  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  53.74 
 
 
248 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  53.74 
 
 
268 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  48.42 
 
 
270 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 
270 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 
270 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  54.61 
 
 
169 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  56.03 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  55.94 
 
 
158 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 
141 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
142 aa  93.2  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
149 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 
150 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
172 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 
305 aa  64.7  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
138 aa  62  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  41.49 
 
 
140 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  34.31 
 
 
325 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
311 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
311 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
311 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
137 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
301 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  41.11 
 
 
322 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35 
 
 
317 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
310 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  35.45 
 
 
424 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
299 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  38.24 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
136 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 
583 aa  52.8  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
333 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
142 aa  52  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
211 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
144 aa  52  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
289 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  34 
 
 
143 aa  51.2  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 
208 aa  51.2  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
144 aa  51.2  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
216 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
139 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
141 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
536 aa  50.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  34.33 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.08 
 
 
131 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.13 
 
 
315 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  33.85 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  47.06 
 
 
137 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  36.04 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  34.33 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  34 
 
 
302 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  36.04 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 
140 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
231 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
140 aa  48.5  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  29 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  34.41 
 
 
140 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  30.61 
 
 
301 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.96 
 
 
167 aa  48.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
140 aa  48.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  29 
 
 
137 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
190 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
146 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>