130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3106 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 278 aa  517  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  43.96 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  42.32 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  42.57 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  42.17 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  40.56 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  37.5 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0613  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  33.73 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3801  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  29.85 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.49 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.87 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4920  ABC-2 type transporter  39.77 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0926  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  27.94 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.13 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7157  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  33.12 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.024158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0290  putative integral membrane protein  26.62 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528279  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2470  ABC-2 type transporter  35.59 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218035  hitchhiker  0.00397591 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.22 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0348  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0113875  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  27.97 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0712  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 374 aa  52.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  31.69 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  29.6 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33060  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.71 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.486477  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  28.05 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1586  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0344  ABC-2 type transporter  31.37 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.261927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.14 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 366 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.79 
 
 		 356 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 251 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 		 266 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.26 
 
 		 359 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.72 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  26.49 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  26.25 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 381 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1716  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 366 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  30.07 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.82 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  29.91 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  29.91 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  29.91 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 371 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 244 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 		 244 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.5 
 
 		 327 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  23.66 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  23.66 
 
 		 244 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  24.1 
 
 		 381 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.21 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  24.7 
 
 		 381 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.21 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1290  ABC-2 type transporter  21.68 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000900917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  34.67 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  27.33 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>