More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4449 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00887  Putative urea carboxylase (EC 6.3.4.6)(Urea amidolyase)(Lactam utilization protein lamA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38095]  39.17 
 
 		 1241 aa  875    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.547459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2393  urea carboxylase  55.7 
 
 		 1201 aa  1288    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6105  urea carboxylase  56.64 
 
 		 1179 aa  1323    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164711  normal  0.417784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2606  urea carboxylase  55.79 
 
 		 1172 aa  1299    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0045  urea carboxylase  56.02 
 
 		 1197 aa  1305    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4243  urea amidolyase-related protein  56.19 
 
 		 1226 aa  1332    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0798  urea carboxylase  58.52 
 
 		 1208 aa  1403    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2680  urea carboxylase  55.28 
 
 		 1200 aa  1290    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1105  urea carboxylase  52.15 
 
 		 1208 aa  1237    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.480964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1594  urea amidolyase related protein  52.38 
 
 		 663 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3977  Urea amidolyase-related protein  58.09 
 
 		 1488 aa  890    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3089  urea carboxylase  59.25 
 
 		 1204 aa  1430    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.176139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0074  allophanate hydrolase subunit 2  60.02 
 
 		 1201 aa  1402    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.755435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0766  urea carboxylase  52.73 
 
 		 1201 aa  1209    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0036  biotin carboxylation domain-containing protein  59.93 
 
 		 1203 aa  1421    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4883  allophanate hydrolase subunit 2  59.09 
 
 		 1233 aa  1375    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104085  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28452  urea amidolyase  44.98 
 
 		 1822 aa  1108    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.407983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3722  urea carboxylase  57.31 
 
 		 1176 aa  1304    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.848646  normal  0.673189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1821  biotin carboxylation domain-containing protein  54.93 
 
 		 1205 aa  1193    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.234186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1338  allophanate hydrolase subunit 2  56.07 
 
 		 1210 aa  1316    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0387482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2304  urea carboxylase  58.42 
 
 		 1209 aa  1418    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.198231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3792  urea amidolyase related protein  57.46 
 
 		 1228 aa  1347    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2502  propionyl-coenzyme A carboxylase alpha polypeptide  55.27 
 
 		 1243 aa  1333    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2163  urea carboxylase  53.75 
 
 		 1204 aa  1264    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.278684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1792  allophanate hydrolase subunit 2  54.38 
 
 		 1206 aa  1336    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.73882  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2748  urea carboxylase  54.41 
 
 		 1204 aa  1250    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3728  urea carboxylase  52.88 
 
 		 1220 aa  1163    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0435399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0943  allophanate hydrolase subunit 2  57.47 
 
 		 1212 aa  1404    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.648902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3900  urea carboxylase  57.88 
 
 		 1179 aa  1284    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0703  urea amidolyase related protein  55.22 
 
 		 1209 aa  1278    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1588  urea carboxylase  57.37 
 
 		 1182 aa  1328    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0606  allophanate hydrolase subunit 2  66.61 
 
 		 1197 aa  1583    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0957568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4017  urea carboxylase  57.72 
 
 		 1176 aa  1307    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1127  putative allophanate hydrolase  53.5 
 
 		 1209 aa  1303    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4531  allophanate hydrolase subunit 2  57.31 
 
 		 1183 aa  1338    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3888  urea amidolyase related protein  52.89 
 
 		 677 aa  684    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0446544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1358  biotin carboxylation domain-containing protein  55.75 
 
 		 1231 aa  1287    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.306676  normal  0.336229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1384  Urea amidolyase-related protein  58.38 
 
 		 1205 aa  1371    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578782  normal  0.0177378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1222  Urea carboxylase  56.72 
 
 		 1180 aa  1273    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2188  allophanate hydrolase subunit 2  56.51 
 
 		 1183 aa  1314    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2502  urea carboxylase  53.01 
 
 		 1204 aa  1239    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1892  Urea carboxylase  56.18 
 
 		 1205 aa  1340    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.434507  normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1887  biotin carboxylation domain-containing protein  55.06 
 
 		 1205 aa  1194    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2727  biotin carboxylation domain-containing protein  55.72 
 
 		 1162 aa  721    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.321905  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3979  urea carboxylase  57.24 
 
 		 1203 aa  1284    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4449  urea carboxylase  100 
 
 		 1238 aa  2477    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5558  allophanate hydrolase subunit 2  58.82 
 
 		 1205 aa  1363    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.453459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1840  allophanate hydrolase  55.06 
 
 		 1205 aa  1194    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6430  urea carboxylase  59.15 
 
 		 1205 aa  1372    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  54.81 
 
 		 1207 aa  1267    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0904  Urea carboxylase  53.32 
 
 		 1204 aa  1128    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.332628  normal  0.0380086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0710  urea carboxylase  52.14 
 
 		 1212 aa  1099    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013863 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6517  urea carboxylase  56.16 
 
 		 1179 aa  1315    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2361  urea amidolyase related protein  57.6 
 
 		 1200 aa  1357    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5228  urea carboxylase  58.04 
 
 		 1203 aa  1394    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3669  urea amidolyase related protein  54.8 
 
 		 1234 aa  1222    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5923  biotin carboxylation region  58.82 
 
 		 1205 aa  1363    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.559652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2125  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  46.89 
 
 		 662 aa  409  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0487  propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  46.54 
 
 		 655 aa  405  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3370  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.13 
 
 		 680 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.447293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1869  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.34 
 
 		 676 aa  406  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3403  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.11 
 
 		 696 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2788  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.24 
 
 		 673 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.683073  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1147  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  52.81 
 
 		 667 aa  402  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.221564 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03803  biotin carboxylase  52.35 
 
 		 675 aa  402  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1840  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.95 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0175  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.99 
 
 		 449 aa  399  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0723  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.6 
 
 		 681 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.124518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0539  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  46.19 
 
 		 656 aa  397  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1803  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.87 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.220445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.66 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.64 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  50.22 
 
 		 645 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1020  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  49.89 
 
 		 670 aa  399  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5683  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  50.11 
 
 		 666 aa  400  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30510  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  49.77 
 
 		 665 aa  398  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.434229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.76 
 
 		 446 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1826  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.53 
 
 		 446 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4238  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.22 
 
 		 670 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0018  biotin carboxylase  50.45 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1792  hypothetical protein  47.86 
 
 		 654 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2772  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  47.18 
 
 		 671 aa  396  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4535  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  52.22 
 
 		 662 aa  397  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5118  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  52.68 
 
 		 666 aa  396  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0751  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  51.35 
 
 		 667 aa  397  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0015  biotin carboxylase  50.23 
 
 		 673 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  48.3 
 
 		 662 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.817206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1855  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  52.98 
 
 		 666 aa  396  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.181486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4585  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  52.68 
 
 		 666 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0794  pyruvate carboxylase subunit A  43.83 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2441  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  48.66 
 
 		 450 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0039  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  50.23 
 
 		 655 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.540073  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3684  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.3 
 
 		 685 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.82326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6137  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  49.66 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768375  normal  0.18157 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2302  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  48.08 
 
 		 666 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1587  pyruvate carboxylase subunit A  46.07 
 
 		 493 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  47.09 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0913  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.06 
 
 		 678 aa  392  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0865  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  47.86 
 
 		 666 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.246208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2515  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  49.11 
 
 		 682 aa  393  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370768  normal  0.591821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>