114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0218 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  827    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3048  hypothetical protein  29.56 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.756675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.64 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.3 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  33.06 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  26.98 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  26.91 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.13 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  37.63 
 
 		 443 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  22.45 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  37.63 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  25.87 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.14 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  35.48 
 
 		 438 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.67 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 642 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  35.48 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  25 
 
 		 1069 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.53 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  26.53 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  26.8 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  32.69 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.69 
 
 		 432 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.09 
 
 		 446 aa  50.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.58 
 
 		 590 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4234  transcriptional regulatory protein-like  26.49 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  27.37 
 
 		 1078 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  30.56 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  22.65 
 
 		 1005 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  32.69 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.63 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.15 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.18 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  24.72 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  27.03 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.63 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.25 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.84 
 
 		 1081 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  31.19 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  25.93 
 
 		 774 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  32.63 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 969 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  25.39 
 
 		 1060 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  31.73 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.96 
 
 		 1059 aa  47.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  23.73 
 
 		 430 aa  47  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  27.88 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.12 
 
 		 621 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.68 
 
 		 673 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  31.18 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  25.95 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  24.68 
 
 		 1066 aa  47  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  31.18 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  28.7 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.21 
 
 		 1078 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  23.73 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.72 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.94 
 
 		 660 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0536  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.07 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  26.4 
 
 		 441 aa  46.6  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  30.34 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  25.9 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  30.91 
 
 		 1097 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  25.9 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.7 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  30.11 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  24.49 
 
 		 1167 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.79 
 
 		 670 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3363  hypothetical protein  28.57 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000877827  hitchhiker  0.00789659 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  23.55 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  28.57 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  24.9 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  25 
 
 		 1090 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  24.9 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  24.9 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  25.81 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2002  WD40 domain protein beta Propeller  26.67 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.34 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  24.86 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  27.4 
 
 		 1065 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1833  hypothetical protein  27.36 
 
 		 528 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000463008  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26.29 
 
 		 1062 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  28.05 
 
 		 1010 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.11 
 
 		 678 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.9 
 
 		 567 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2602  hypothetical protein  29.29 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  24.81 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  24.81 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  24.81 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  24.81 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  24.81 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1156  translocation protein TolB  24.42 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  29.75 
 
 		 632 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.54 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  24.92 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>