192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0079 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  100 
 
 		 257 aa  535  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  36.08 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  38.78 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  35.66 
 
 		 238 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  35.66 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  36.4 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  35.66 
 
 		 240 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  34.36 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  36.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  34.88 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  36.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  36.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.27 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  36.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  34.88 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  36.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  34.88 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  36.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  36.02 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  36.05 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  34.88 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  34.5 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  34.75 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  35.66 
 
 		 240 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  34.82 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  35.27 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  34.25 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  32.95 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  32.95 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  32.95 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  32.95 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  30.83 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  34.23 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  30.86 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  31.8 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  32.56 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  32.57 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  34.1 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  33.04 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.01 
 
 		 238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  31.28 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.85 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.96 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.08 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  30 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  30.4 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  31.84 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  28.11 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  26.1 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  30.59 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 234 aa  89  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  29.79 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  27.2 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.42 
 
 		 233 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  26.4 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 233 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  26.88 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.39 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  25.51 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.25 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.3 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  23.48 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.56 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  25.51 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  25.81 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  24.12 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.17 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.31 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  25.12 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  25.12 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  25.12 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5775  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.15 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.09 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  23.79 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  23.79 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  23.85 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  24.25 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.3 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.2 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  23.94 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>