237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1546 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0440  putative soluble lytic murein transglycosylase  68.75 
 
 		 545 aa  777    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00101982  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1546  transglycosylase SLT domain-containing protein  100 
 
 		 545 aa  1115    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0107  soluble lytic murein transglycosylase, putative  45.3 
 
 		 540 aa  478  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0930  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.37 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0395136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0992  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.37 
 
 		 541 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0469572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0859  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.37 
 
 		 541 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.509195  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0719  soluble lytic murein transglycosylase, SLT family  41.85 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.273339  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1378  putative soluble lytic murein transglycosylase  40.48 
 
 		 542 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0678  Lytic transglycosylase catalytic  35.83 
 
 		 547 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.906307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  37.96 
 
 		 556 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  35.22 
 
 		 735 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 671 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  33.13 
 
 		 691 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  27.33 
 
 		 746 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  36.84 
 
 		 593 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  36.84 
 
 		 593 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 642 aa  73.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  33.54 
 
 		 691 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  34.01 
 
 		 749 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  33.13 
 
 		 709 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  27.62 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  32.28 
 
 		 747 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  30.81 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  34.56 
 
 		 782 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 777 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  32.39 
 
 		 833 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  29.81 
 
 		 788 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  32.7 
 
 		 672 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 663 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  29.75 
 
 		 745 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  30.86 
 
 		 774 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  30.86 
 
 		 774 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  29.17 
 
 		 747 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  31.33 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 		 757 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  36.76 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 760 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  33.57 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  32.59 
 
 		 654 aa  67.8  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  31.58 
 
 		 690 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  30.19 
 
 		 712 aa  67  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  31.39 
 
 		 647 aa  67  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 690 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  27.33 
 
 		 804 aa  66.6  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 750 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  31.97 
 
 		 750 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 637 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  31.97 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  29.81 
 
 		 685 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  31.74 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 		 653 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  25.77 
 
 		 680 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  33.57 
 
 		 719 aa  64.3  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  32.39 
 
 		 800 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  34.46 
 
 		 677 aa  63.9  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  29.94 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  27.68 
 
 		 677 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  31.62 
 
 		 197 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.29 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  32.85 
 
 		 650 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  30.66 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 747 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  33.82 
 
 		 678 aa  62.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  30.81 
 
 		 729 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  32.85 
 
 		 607 aa  62  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  32.85 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  30.43 
 
 		 709 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 679 aa  62  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  32.85 
 
 		 650 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  32.85 
 
 		 650 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.94 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  30.94 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  29.02 
 
 		 628 aa  62  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  25.93 
 
 		 644 aa  61.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  27.75 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  32.82 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  32.43 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.13 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  30.5 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  28.38 
 
 		 652 aa  60.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.07 
 
 		 669 aa  60.1  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  29.71 
 
 		 709 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  31.76 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  31.76 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  31.76 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  31.08 
 
 		 685 aa  60.1  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  29.2 
 
 		 649 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  31.76 
 
 		 645 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  29.58 
 
 		 763 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  32.12 
 
 		 772 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 		 661 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  32.06 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  32.06 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  32.06 
 
 		 645 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>