More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4999 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4999  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
358 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399677  normal  0.336423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2126  secretion protein HlyD family protein  77.93 
 
 
358 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  73.88 
 
 
358 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1696  secretion protein HlyD family protein  77.09 
 
 
358 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  53.15 
 
 
358 aa  340  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  57.38 
 
 
352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  57.05 
 
 
354 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  51.96 
 
 
349 aa  328  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  50.74 
 
 
358 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  47.84 
 
 
358 aa  316  5e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  51.24 
 
 
413 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  51.6 
 
 
356 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  52.85 
 
 
360 aa  302  5.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  51.81 
 
 
353 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  50.3 
 
 
385 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  48.35 
 
 
383 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  51.67 
 
 
367 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  53.56 
 
 
396 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  51.67 
 
 
367 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  49.4 
 
 
344 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  51.2 
 
 
353 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  46.86 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  50.15 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  49.1 
 
 
394 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46390  secretion protein  49.06 
 
 
354 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  43.24 
 
 
380 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1819  secretion protein HlyD family protein  46.53 
 
 
383 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.333627  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  44.28 
 
 
380 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  44.04 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  46.08 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  44.35 
 
 
363 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  41.08 
 
 
393 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  44.44 
 
 
375 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  39.53 
 
 
414 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  42.51 
 
 
373 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  44.12 
 
 
378 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 
400 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 
390 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  42.24 
 
 
363 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  39.44 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  41.98 
 
 
377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  41.91 
 
 
363 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  43.23 
 
 
363 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  38.68 
 
 
350 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.64 
 
 
375 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.86 
 
 
344 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  41.87 
 
 
372 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  40.32 
 
 
346 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  41.58 
 
 
364 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  41.58 
 
 
364 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 
344 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  41.58 
 
 
364 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.57 
 
 
355 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  42.46 
 
 
382 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  39.94 
 
 
381 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  40.11 
 
 
372 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 
366 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 
368 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  41.25 
 
 
364 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  40.33 
 
 
352 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 
365 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00461  transport protein  40.98 
 
 
400 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  38.72 
 
 
348 aa  202  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  37.39 
 
 
393 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 
390 aa  200  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 
374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.76 
 
 
422 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5067  secretion protein HlyD family protein  39.66 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  39.58 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  36.86 
 
 
344 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 
347 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  36.28 
 
 
406 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  36.67 
 
 
404 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  35.76 
 
 
359 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  39.04 
 
 
373 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  34.3 
 
 
355 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  36.58 
 
 
349 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  41.55 
 
 
374 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  34.74 
 
 
334 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  38.51 
 
 
372 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 
387 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 
387 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.28 
 
 
371 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  41.55 
 
 
374 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  41.55 
 
 
374 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  36.58 
 
 
349 aa  193  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.67 
 
 
351 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  42.3 
 
 
397 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  39.5 
 
 
363 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48280  putative multidrug resistance efflux pump  40.75 
 
 
383 aa  192  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0160418  normal  0.0591644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.69 
 
 
404 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 
349 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  36.05 
 
 
366 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  38.05 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  39.02 
 
 
397 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  34.35 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  34.35 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>