91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  618  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  42.42 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  41.26 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  43.43 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  43.27 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  41.7 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  45.49 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  41.56 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  42.42 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  47.22 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  42.74 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  41.88 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  41.11 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  36.09 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  41.03 
 
 		 516 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  35.5 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  40.47 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  35.71 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  38.16 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  39.62 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  39.72 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  39.52 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  37.37 
 
 		 500 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  35.59 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  35.82 
 
 		 517 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  35.03 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  31.74 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  37.98 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  32.9 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  32.9 
 
 		 514 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  35.91 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  35.05 
 
 		 492 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  33.92 
 
 		 514 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  32.89 
 
 		 271 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  33.8 
 
 		 262 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  36.02 
 
 		 517 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  32.03 
 
 		 514 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  32.03 
 
 		 514 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  30.74 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  33.96 
 
 		 272 aa  86.7  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  30.73 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  28.11 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  32.02 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  25.29 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  29.87 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  30.23 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.98 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.16 
 
 		 516 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.12 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.41 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  27.52 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  32.3 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  23.33 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  28.65 
 
 		 551 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  28.32 
 
 		 541 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.04 
 
 		 248 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  29.17 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  29.17 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.9 
 
 		 551 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  28.86 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  27.98 
 
 		 502 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  27.52 
 
 		 551 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  30.39 
 
 		 548 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  26.35 
 
 		 558 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  32.28 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  30 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  28.05 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  26.67 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  27.65 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0336  spermine synthase  28.99 
 
 		 235 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  31.5 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  30.16 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  31.5 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  31.5 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  30.07 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30.39 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  29.45 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  23.66 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  23.93 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  29.52 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  27.75 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  22.08 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  25.97 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  25.97 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  25.97 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  26.04 
 
 		 322 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  24.53 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  24.53 
 
 		 247 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  25.97 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  25.32 
 
 		 247 aa  43.1  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  24.53 
 
 		 247 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>