More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2309 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  50.5 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  44.28 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 192 aa  114  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  33.17 
 
 		 212 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 251 aa  91.3  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3340  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
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NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0035  putative transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
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NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.46 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  26.21 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.42 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
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NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
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NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  27.72 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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