More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0922 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0922  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 378 aa  748    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2577  transcriptional regulator, LuxR family  43.11 
 
 		 372 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1037  transcriptional regulator, LuxR family  39.31 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2488  LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.008035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  32.73 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3938  response regulator receiver protein  37.24 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  0.0101023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1468  transcriptional regulator, LuxR family protein  28.35 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468229  hitchhiker  0.0000161531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3500  LuxR family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2191  LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.218442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 374 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0440  LuxR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 323 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3565  regulatory protein LuxR  29.94 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1021  transcriptional regulator, LuxR family  28.88 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 240 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1438  LuxR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0591  hypothetical protein  44.83 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3529  transcriptional regulator, LuxR family  29.34 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0062  LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0807  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.54 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.218712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 950 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  25.1 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 775 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 680 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 151 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  29.1 
 
 		 556 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1115  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.43 
 
 		 225 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0541844  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  45.59 
 
 		 567 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 904 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1243  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 550 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3530  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 272 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.941293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4373  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 894 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3993  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  49.06 
 
 		 896 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 514 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.55 
 
 		 211 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 514 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7171  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 76 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.710202  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 514 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 220 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 510 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 510 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 510 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3596  transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445896  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3528  transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 178 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.993919  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 895 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  47.46 
 
 		 947 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 881 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2681  LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 74 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  48.08 
 
 		 205 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  42.65 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 881 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 876 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0590  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822458  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2324  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.64 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1652  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.58 
 
 		 215 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0166  transcriptional regulator, LuxR family protein  39.66 
 
 		 207 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00243136  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1637  LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 272 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00717804  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0878  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1105  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1019  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1845  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301448  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.28 
 
 		 862 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  43.1 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 910 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 		 241 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 230 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 894 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 250 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 219 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0747  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.643618  normal  0.38139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0656  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.214241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3447  LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 175 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 216 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  47.54 
 
 		 216 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 224 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 960 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 224 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 196 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  43.94 
 
 		 872 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 189 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1819  LuxR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  42.35 
 
 		 196 aa  50.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 176 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3842  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 		 268 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 496 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4209  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 266 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.235438 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  49.12 
 
 		 545 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 191 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>