More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0463 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0463  HlyD family secretion protein  100 
 
 
314 aa  620  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0402  HlyD family secretion protein  99.04 
 
 
314 aa  614  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  82.48 
 
 
314 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5057  secretion protein HlyD family protein  50.32 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  36.52 
 
 
344 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  39.51 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0456  secretion protein HlyD family protein  41.58 
 
 
324 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.119386  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4329  secretion protein HlyD family protein  40.34 
 
 
327 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0350  secretion protein HlyD  37.41 
 
 
320 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1719  secretion protein HlyD  33.76 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0706497  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1084  HlyD family secretion protein  38.89 
 
 
356 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.335201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0409  secretion protein HlyD  36.24 
 
 
332 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3452  HlyD family secretion protein  35.4 
 
 
326 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349475  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  33.33 
 
 
326 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1342  HlyD family secretion protein  32.34 
 
 
317 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  33.01 
 
 
332 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0052  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 
324 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0055  secretion protein HlyD family protein  36.81 
 
 
324 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.873688  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3691  secretion protein HlyD family protein  40.2 
 
 
320 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4164  secretion protein HlyD family protein  41.11 
 
 
320 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.571077  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0163  lipoprotein  37.75 
 
 
311 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0904469  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4665  secretion protein HlyD family protein  39.3 
 
 
328 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267783  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0506  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
317 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  33.71 
 
 
359 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1792  putative efflux protein  30.36 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0000336857  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4312  hypothetical protein  31.01 
 
 
267 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2707  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 
328 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0650452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5305  hypothetical protein  31.55 
 
 
258 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.141224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3668  putative efflux protein  29.82 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285174  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0717  hypothetical protein  30.45 
 
 
257 aa  122  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.99 
 
 
320 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  32.95 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.3 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  27.81 
 
 
316 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0587  hypothetical protein  30 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654708  hitchhiker  0.0000117707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34.58 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  31.48 
 
 
345 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  31.48 
 
 
345 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  28.52 
 
 
344 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  36.19 
 
 
350 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 
315 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.9 
 
 
354 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  33.67 
 
 
333 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  28.82 
 
 
329 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 
349 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  33.47 
 
 
415 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1250  hypothetical protein  28.71 
 
 
322 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  30.14 
 
 
335 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  30.8 
 
 
343 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.59 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  32.18 
 
 
344 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  28.62 
 
 
328 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  28.62 
 
 
328 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06357  hypothetical protein  29.07 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  29.18 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  29.79 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1035  secretion protein HlyD  37.18 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.833081  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  32.95 
 
 
346 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  29.39 
 
 
323 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  27.68 
 
 
315 aa  92.8  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.44 
 
 
395 aa  92.4  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  29.82 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  30.74 
 
 
342 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  21.29 
 
 
327 aa  92  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  30.82 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001404  membrane-fusion protein  28.12 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  29.69 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 
420 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  27.07 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0123  hypothetical protein  25.9 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  32.03 
 
 
421 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 
496 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.44 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  31.83 
 
 
377 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  28.99 
 
 
359 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  30.71 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  28.57 
 
 
334 aa  87  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  23.26 
 
 
326 aa  86.3  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 
328 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 
496 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  29.93 
 
 
328 aa  85.9  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  25.94 
 
 
356 aa  86.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  26.23 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  28.11 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2440  secretion protein HlyD family protein  32.28 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.41732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  29.22 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  30.22 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  31 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3589  HlyD family secretion protein  30.45 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  28.81 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  30.1 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  31.45 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  28.33 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  27.86 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  25 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  26.57 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>