246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3600 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3600  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0028  sterol desaturase  48.76 
 
 		 282 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1138  sterol desaturase-like protein  37.7 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3352  fatty acid hydroxylase  31.16 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.211672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4434  fatty acid hydroxylase  31.68 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00391015  normal  0.0114256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1433  hypothetical protein  29.22 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1451  hypothetical protein  29.22 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5741  hypothetical protein  29.86 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4555  hypothetical protein  28.96 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2704  sterol desaturase  35.08 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3816  sterol desaturase  37.57 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11823  probable transmembrane protein  36.16 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6885  fatty acid hydroxylase  30.52 
 
 		 413 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7026  hypothetical protein  37.36 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0170073  normal  0.638792 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5320  hypothetical protein  30.65 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.573782 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5691  hypothetical protein  30.65 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.460531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3683  hypothetical protein  29.72 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5395  fatty acid hydroxylase  30.45 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2318  hypothetical protein  32.37 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3537  fatty acid hydroxylase  34.44 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.351469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2098  sterol desaturase  35 
 
 		 374 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.520582  normal  0.627756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2354  sterol desaturase-like protein  29.13 
 
 		 400 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55230  hypothetical protein  32.94 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.226286  hitchhiker  0.000000221588 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5286  hypothetical protein  29.39 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.789525  normal  0.137555 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5722  hypothetical protein  29.39 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0212  hypothetical protein  28.51 
 
 		 269 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4808  hypothetical protein  30.88 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0507867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2304  fatty acid hydroxylase  31.56 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2774  putative transmembrane protein  30.64 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.994499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0347  fatty acid hydroxylase  28.42 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1362  fatty acid hydroxylase  33.51 
 
 		 257 aa  93.6  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000314622  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2374  fatty acid hydroxylase  29.71 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00297557  normal  0.604187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1644  fatty acid hydroxylase  35.43 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1574  sterol desaturase, putative  33.53 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0147058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05005  probable transmembrane protein  30.22 
 
 		 256 aa  90.9  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4626  fatty acid hydroxylase  32.93 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0758609  hitchhiker  0.00836397 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4494  fatty acid hydroxylase  32.93 
 
 		 401 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.007915  normal  0.118809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1248  fatty acid hydroxylase  31.3 
 
 		 281 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0600  sterol desaturase-like  30.26 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01698  hypothetical protein  32.34 
 
 		 385 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0386662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3994  fatty acid hydroxylase  31.9 
 
 		 256 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000572359 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1443  fatty acid hydroxylase  33.72 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000016954  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7012  fatty acid hydroxylase  31.37 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2963  putative sterol desaturase  28.93 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3135  sterol desaturase-like  31.82 
 
 		 250 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1393  sterol desaturase  29.75 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.015069  normal  0.782198 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6645  fatty acid hydroxylase  32.47 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00730628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02945  sterol desaturase-related protein  32.89 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3910  fatty acid hydroxylase  30.88 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3724  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  28.19 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0427  sterol desaturase-like protein  31.12 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3919  hypothetical protein  26.53 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0425418  normal  0.393251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3298  fatty acid hydroxylase  29.39 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3878  putative sterol desaturase  34.23 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0647  fatty acid hydroxylase  28.05 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0651  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0624  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1331  fatty acid hydroxylase  28.49 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0540  fatty acid hydroxylase  30.63 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3738  putative transmembrane protein  28.05 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2161  hypothetical protein  30.67 
 
 		 400 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0387  hypothetical protein  32.24 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01793  putative C-5 sterol desaturase  29.21 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14977  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3780  fatty acid hydroxylase  28.03 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0389  sterol desaturase  26.34 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0537  fatty acid hydroxylase  28.23 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2188  hypothetical protein  30 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0910  sterol desaturase-like  33.33 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7771  fatty acid hydroxylase  32.22 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1001  sterol desaturase-related protein  30 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3510  sterol desaturase  29.73 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.695011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2637  fatty acid hydroxylase  25.62 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03346  sterol desaturase protein  27.75 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5128  sterol desaturase-like protein  31.17 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2988  sterol desaturase-like  33.33 
 
 		 339 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5219  hypothetical protein  29.87 
 
 		 431 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003512  sterol desaturase  27.66 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1116  fatty acid hydroxylase  29.57 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03450  hypothetical protein  25.84 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.041637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1204  sterol desaturase-like protein  27.92 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2296  fatty acid hydroxylase  28.42 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0175363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5280  fatty acid hydroxylase  29.22 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0242  hypothetical protein  27.89 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0972  putative sterol desaturase  29.79 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1960  sterol desaturase-related protein  27.55 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.342543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5467  hypothetical protein  25.95 
 
 		 411 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189673  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1804  hypothetical protein  30.57 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000255396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3134  sterol desaturase-like  30.41 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.278147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0365  fatty acid hydroxylase  30.22 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1326  sterol desaturase-related protein  27.85 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3610  fatty acid hydroxylase  27.85 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46520  hypothetical protein  33.09 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1941  fatty acid hydroxylase  25.24 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0823241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0678  fatty acid hydroxylase  27.65 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409553  normal  0.565503 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3766  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288136  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4042  fatty acid hydroxylase  32.65 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.95273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1983  fatty acid hydroxylase  26.2 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5042  fatty acid hydroxylase  28.48 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4808  fatty acid hydroxylase  29.29 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0968431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0617  fatty acid hydroxylase  26.03 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>