58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1190 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  79.27 
 
 
184 aa  292  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  44.88 
 
 
202 aa  175  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  38.26 
 
 
220 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  36.97 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  34.62 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  32.35 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  37.69 
 
 
221 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  32.89 
 
 
267 aa  86.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  37.69 
 
 
180 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  40.28 
 
 
231 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  36.88 
 
 
166 aa  85.5  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  34.07 
 
 
267 aa  85.1  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  38.89 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  32.61 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  32.33 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  36.76 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  34.11 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  31.65 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  33.59 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  34.92 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  32.61 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  35.21 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  31.45 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  36.03 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  31.25 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  38.52 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  30.99 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  30.52 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  30.67 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  34.03 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  28.17 
 
 
272 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  27.46 
 
 
240 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  28.87 
 
 
229 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  28.87 
 
 
229 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  27.46 
 
 
227 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  28.87 
 
 
229 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  28.48 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  27.21 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  33.09 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  24.18 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  31.75 
 
 
147 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  29.86 
 
 
165 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  35.23 
 
 
139 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  26.56 
 
 
143 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  45.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  30.16 
 
 
135 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  26.98 
 
 
146 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  39.34 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  26.9 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  30.25 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  28.66 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0141  GtrA family protein  32.61 
 
 
141 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  26.35 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  27.54 
 
 
130 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  28.42 
 
 
154 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3658  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.08 
 
 
377 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>