More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0906 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 		 1138 aa  939    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 		 1120 aa  939    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  53.42 
 
 		 1098 aa  1016    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 1172 aa  905    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 1111 aa  916    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.14 
 
 		 1147 aa  915    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 1112 aa  915    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 1101 aa  922    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 1100 aa  1044    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 1113 aa  941    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 1112 aa  915    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 1100 aa  927    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1094 aa  2145    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 496 aa  581  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 500 aa  572  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 		 506 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 		 500 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 499 aa  548  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 501 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  51.74 
 
 		 503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 512 aa  469  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.2 
 
 		 510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 500 aa  452  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  49.08 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 501 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 512 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 507 aa  435  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  45.92 
 
 		 565 aa  434  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 504 aa  432  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 516 aa  426  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 560 aa  426  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 520 aa  411  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 573 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  45.9 
 
 		 592 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 1118 aa  400  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 499 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 489 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 491 aa  393  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  32.79 
 
 		 917 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 509 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 509 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 504 aa  389  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 562 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 561 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 502 aa  385  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 573 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 489 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 515 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 515 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 508 aa  383  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2354  lysyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0808673  decreased coverage  0.00196891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 515 aa  378  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 501 aa  379  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 501 aa  379  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 494 aa  376  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.49 
 
 		 771 aa  375  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 502 aa  376  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0078  lysyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518607  normal  0.367083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05510  lysyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 563 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 508 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 1132 aa  373  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 502 aa  373  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 502 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>