214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0361 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  46.96 
 
 
228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  49.32 
 
 
230 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  49.32 
 
 
230 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  49.32 
 
 
230 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  48.89 
 
 
235 aa  178  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  49.55 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.58 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.99 
 
 
230 aa  157  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.28 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  45.39 
 
 
209 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  39.58 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  37.7 
 
 
253 aa  95.1  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1991  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.09 
 
 
219 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.56 
 
 
228 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.42 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.61 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  38 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  29.65 
 
 
219 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  25.87 
 
 
234 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  29.26 
 
 
292 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  35.05 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.59 
 
 
237 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  26.52 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  43.02 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  43.02 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  30.29 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  29.27 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.22 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2832  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.24 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  25.98 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.93 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  24.78 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
258 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.21 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  37.78 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 
223 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  37.78 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  37.78 
 
 
243 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.89 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.78 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  35.8 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  30.29 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.14 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  31.13 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.18 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.68 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.08 
 
 
223 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  45 
 
 
226 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.68 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  38.98 
 
 
204 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  33.61 
 
 
245 aa  48.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
240 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.81 
 
 
234 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  34.55 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.84 
 
 
190 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  40.91 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.47 
 
 
260 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  47.62 
 
 
237 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  34.52 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.16 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  37.97 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.19 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.19 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  45.31 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.62 
 
 
244 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.98 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.68 
 
 
239 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.66 
 
 
212 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.19 
 
 
230 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  41.43 
 
 
229 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 
244 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.16 
 
 
237 aa  46.6  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
240 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  48.98 
 
 
193 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  38.83 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.98 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  28.19 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  52.17 
 
 
229 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.53 
 
 
267 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0025  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.56 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  32.69 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  34.25 
 
 
246 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  36.78 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  28.18 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.73 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.35 
 
 
250 aa  45.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.42 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>