148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3629 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
176 aa  356  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  72.5 
 
 
167 aa  226  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 
154 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  37.14 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  34.75 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18870  transcriptional regulator  38.62 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.452318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  39.64 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  41.94 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  31.37 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 
203 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  31.75 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 
154 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 
157 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  32.52 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
195 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
152 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 
173 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
189 aa  54.3  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  31.13 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
161 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  31.82 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
160 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
181 aa  51.6  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  37.88 
 
 
197 aa  50.8  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 
169 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  26.23 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  32.26 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 
161 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  25.37 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  29.31 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  38.1 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
181 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 
153 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0718  regulatory protein, MarR  31.46 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000013596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  43.55 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  29.41 
 
 
150 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  24.55 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
162 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  27.59 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1337  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0613  transcriptional regulator of MarR family protein  33.78 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.137964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1193  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0667234  hitchhiker  0.0000268164 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  26.75 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  26.37 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>