More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0942 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0942  translation initiation factor aIF-2  100 
 
 
578 aa  1155    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1302  translation initiation factor IF-2  55.38 
 
 
602 aa  639    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  54.86 
 
 
591 aa  634  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2294  translation initiation factor IF-2  51.96 
 
 
591 aa  624  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  54.45 
 
 
591 aa  624  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0461  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 
593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2489  translation initiation factor IF-2  52.47 
 
 
604 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0339  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
593 aa  593  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.618473 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1520  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 
589 aa  585  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.537265  normal  0.628449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  48.81 
 
 
597 aa  566  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  48.9 
 
 
599 aa  566  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0901  translation initiation factor IF-2  49.5 
 
 
598 aa  546  1e-154  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0669  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 
598 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  46.6 
 
 
604 aa  539  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1389  translation initiation factor IF-2  48.5 
 
 
598 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1287  translation initiation factor IF-2  48.67 
 
 
598 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.492003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  47.37 
 
 
607 aa  537  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1600  translation initiation factor IF-2  47.7 
 
 
588 aa  531  1e-149  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1296  translation initiation factor IF-2  47.74 
 
 
598 aa  527  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0628  translation initiation factor IF-2  47.62 
 
 
592 aa  525  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0631  translation initiation factor IF-2  47.53 
 
 
589 aa  525  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.39875  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0638  translation initiation factor IF-2  47.02 
 
 
592 aa  521  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0499  translation initiation factor IF-2  47.7 
 
 
601 aa  521  1e-146  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.116589  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1206  translation initiation factor aIF-2  48.82 
 
 
600 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.142011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0030  translation initiation factor IF-2  46.62 
 
 
597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0331491 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  45.84 
 
 
602 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0229  translation initiation factor IF-2  45.25 
 
 
593 aa  503  1e-141  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0457  translation initiation factor IF-2  45.64 
 
 
594 aa  491  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.202965 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01090  GTPase, putative  40 
 
 
1228 aa  349  8e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.560658  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48964  predicted protein  38.49 
 
 
623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.241447  normal  0.306586 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04038  mitochondrial translation initiation factor IF-2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03970)  35.82 
 
 
1072 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16603  predicted protein  35.28 
 
 
599 aa  329  8e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212191  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82202  predicted protein  39.72 
 
 
997 aa  308  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.236958  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  32.58 
 
 
692 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  29.91 
 
 
732 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  32.39 
 
 
686 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  31.2 
 
 
880 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1208  translation initiation factor IF-2  32.72 
 
 
658 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000392009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  29.65 
 
 
739 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  31.76 
 
 
822 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1934  translation initiation factor IF-2  29.17 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000776037  hitchhiker  0.0000000112049 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  31.14 
 
 
834 aa  181  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0151  translation initiation factor IF-2  31.08 
 
 
690 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000351563  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  30.8 
 
 
883 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0153  translation initiation factor IF-2  30.74 
 
 
693 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000770227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 
686 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  30.04 
 
 
688 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 
686 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 
686 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 
686 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 
689 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  30.22 
 
 
686 aa  178  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  28.7 
 
 
887 aa  178  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  30.04 
 
 
686 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  30.04 
 
 
686 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 
688 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  30.74 
 
 
886 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  30.8 
 
 
924 aa  177  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  30.27 
 
 
888 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  30.42 
 
 
829 aa  176  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  32.38 
 
 
879 aa  176  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  30.73 
 
 
903 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0069  translation initiation factor IF-2  30.15 
 
 
908 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00377162  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  30.6 
 
 
921 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  30.57 
 
 
883 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0074  translation initiation factor IF-2  30.41 
 
 
908 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0422922  normal  0.247669 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1493  translation initiation factor IF-2  30.32 
 
 
838 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00496659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1865  translation initiation factor IF-2  30 
 
 
692 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00943635  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  29.7 
 
 
720 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 
705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  32.1 
 
 
679 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  32.1 
 
 
679 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  29.93 
 
 
705 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  30.67 
 
 
871 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  30.81 
 
 
854 aa  173  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0476  translation initiation factor IF-2  29.53 
 
 
602 aa  173  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258534  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0355  translation initiation factor IF-2  30.04 
 
 
903 aa  172  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000123126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  31.37 
 
 
897 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  29.87 
 
 
882 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  31.36 
 
 
971 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0563  translation initiation factor IF-2  30 
 
 
830 aa  172  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.114537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 
986 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  29.03 
 
 
882 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  30.13 
 
 
673 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2452  translation initiation factor IF-2  30.78 
 
 
904 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00150352  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  31.58 
 
 
868 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  28.24 
 
 
1059 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  28.75 
 
 
1104 aa  171  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0157  translation initiation factor IF-2  29.03 
 
 
905 aa  171  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2020  translation initiation factor IF-2  28.4 
 
 
1030 aa  171  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  31.59 
 
 
956 aa  171  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  30.65 
 
 
985 aa  170  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1441  translation initiation factor IF-2  29.36 
 
 
685 aa  170  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.155659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  30.02 
 
 
980 aa  170  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  29.98 
 
 
975 aa  170  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  29.62 
 
 
884 aa  170  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  31.38 
 
 
848 aa  169  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1318  translation initiation factor IF-2  30.11 
 
 
774 aa  169  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  30.13 
 
 
917 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  31.77 
 
 
938 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>