More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0164 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0164  16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 
217 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  63.33 
 
 
233 aa  254  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  56.52 
 
 
186 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  55.98 
 
 
186 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1386  16S rRNA-processing protein RimM  49.03 
 
 
207 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  53.37 
 
 
182 aa  188  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  47.6 
 
 
208 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  51.1 
 
 
180 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  48.11 
 
 
181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  46.93 
 
 
176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  48.19 
 
 
177 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  42.7 
 
 
176 aa  152  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  43.26 
 
 
176 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  44.2 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  36.96 
 
 
179 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  35.71 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  35.52 
 
 
179 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  35.33 
 
 
179 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  36.87 
 
 
210 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38467  predicted protein  39.39 
 
 
235 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  33.7 
 
 
172 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  31.69 
 
 
173 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  32.77 
 
 
181 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2144  16S rRNA processing protein RimM  34.83 
 
 
176 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  36.87 
 
 
171 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07320  16S rRNA processing protein RimM  33.52 
 
 
170 aa  86.3  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  28.42 
 
 
167 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  36.31 
 
 
170 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1097  16S rRNA processing protein RimM  31.69 
 
 
176 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.349347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1105  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  36.31 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  31.07 
 
 
171 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  35.8 
 
 
171 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0875871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02497  16S rRNA-processing protein  32 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0146885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1066  16S rRNA processing protein RimM  32 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000147404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02461  hypothetical protein  32 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00779193  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2767  16S rRNA-processing protein RimM  32 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1075  16S rRNA-processing protein RimM  32 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024634  normal  0.0162863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2892  16S rRNA-processing protein RimM  32 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2760  16S rRNA-processing protein RimM  32 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0552999  normal  0.0361654 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3847  16S rRNA-processing protein RimM  32 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00015023  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  29.21 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2997  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00151494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  35 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0992  16S rRNA-processing protein RimM  32.83 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  36.52 
 
 
173 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  32.6 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3003  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24752  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2891  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.217231  normal  0.505241 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2889  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0200188  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2820  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0156642  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2870  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.71493  normal  0.0226168 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  29.94 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  29.94 
 
 
171 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  29.94 
 
 
171 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  29.94 
 
 
171 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  29.94 
 
 
171 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  33.53 
 
 
199 aa  79  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0749  16S rRNA-processing protein RimM  28.84 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1355  16S rRNA processing protein RimM  32.02 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000116768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3227  16S rRNA-processing protein RimM  32 
 
 
182 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.155768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43626  predicted protein  30.2 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000259713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  33.15 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1199  16S rRNA processing protein RimM  30.17 
 
 
173 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000995465  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  29.61 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  31.11 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3354  16S rRNA-processing protein RimM  31.98 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0324  16S rRNA processing protein RimM  32.31 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.884603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  30.34 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1494  16S rRNA processing protein RimM  31.21 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0136988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  28.25 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1474  16S rRNA-processing protein RimM  32.77 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1403  16S rRNA-processing protein RimM  30.81 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  27.12 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2859  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2702  16S rRNA-processing protein RimM  32.96 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.294971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  25.7 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3363  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0312668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0969  16S rRNA processing protein RimM  31.07 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000035902  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0881  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.239463  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2333  16S rRNA processing protein RimM  32.57 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377156  normal  0.0588442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1691  16S rRNA-processing protein RimM  30.05 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1885  16S rRNA-processing protein RimM  33.7 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3202  16S rRNA-processing protein RimM  30.73 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0025103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2782  16S rRNA processing protein RimM  35.47 
 
 
172 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  28.25 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1462  16S rRNA-processing protein RimM  30.05 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  28.89 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1029  16S rRNA processing protein RimM  32.96 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.635977  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  29.94 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  28.25 
 
 
171 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  34.81 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1125  16S rRNA-processing protein RimM  30.24 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2874  16S rRNA processing protein RimM  29.84 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  37.02 
 
 
169 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  35.75 
 
 
174 aa  72  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2539  16S rRNA-processing protein RimM  27.86 
 
 
221 aa  72  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  31.28 
 
 
176 aa  72  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0950  16S rRNA-processing protein RimM  29.15 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>