More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3294 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  98.99 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  76 
 
 		 221 aa  264  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  64.1 
 
 		 198 aa  236  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  46.6 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  52.82 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 247 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 224 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 199 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 199 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 342 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  42.42 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 218 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 196 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  31.75 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  51.14 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  21.21 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  21.71 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  29.73 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  34.12 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5796  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0048122 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 225 aa  51.2  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 419 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>