More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1208 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1208  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  56.54 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  55.56 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  43.85 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  42.58 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  41.54 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  40.54 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  44.71 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  41.49 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  37.92 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  40.67 
 
 		 277 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  40.3 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  40.5 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  40.77 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  40.5 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  40.45 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  38.38 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  38.15 
 
 		 278 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  38.66 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  36.57 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5260  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5599  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.693414 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  35.9 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  39.33 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  38.64 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  38.58 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0019  diaminopimelate epimerase  39.38 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  38.97 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  36.98 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0095  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567794 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  39.38 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 293 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 279 aa  165  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  38.97 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  37.05 
 
 		 289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  40.73 
 
 		 286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  34.7 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 		 280 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  37.25 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  37.98 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  40.51 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  35.9 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  34.18 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  40.88 
 
 		 286 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  37.79 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 288 aa  158  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  37.04 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  35.45 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  35.88 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  39.85 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3093  diaminopimelate epimerase  37.88 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  34.34 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  38.04 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  38.17 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  38.17 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0316  diaminopimelate epimerase  37.93 
 
 		 276 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  35.88 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  34.73 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  33.95 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>