More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5169 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  52.26 
 
 		 809 aa  713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  52.8 
 
 		 721 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 723 aa  1476    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  50.07 
 
 		 687 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  50.96 
 
 		 807 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  52.11 
 
 		 809 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  52.26 
 
 		 809 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  68.9 
 
 		 720 aa  972    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  60.28 
 
 		 731 aa  867    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  59.56 
 
 		 717 aa  855    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  51.99 
 
 		 809 aa  710    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  53.12 
 
 		 721 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  44.37 
 
 		 774 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  43.87 
 
 		 777 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  43.21 
 
 		 774 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  44.21 
 
 		 774 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  43.07 
 
 		 774 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  43.07 
 
 		 774 aa  557  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  43.07 
 
 		 774 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  43.05 
 
 		 774 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  43.56 
 
 		 782 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  43.56 
 
 		 782 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  42.13 
 
 		 708 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  44.3 
 
 		 784 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  43.73 
 
 		 784 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  42.59 
 
 		 693 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  42.39 
 
 		 784 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  33.47 
 
 		 675 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 696 aa  313  9e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  31.69 
 
 		 712 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  31.69 
 
 		 703 aa  281  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 710 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  29.68 
 
 		 690 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 704 aa  270  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 711 aa  266  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.25 
 
 		 713 aa  264  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 688 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 731 aa  246  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 782 aa  183  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.5 
 
 		 705 aa  158  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 700 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 751 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  30.18 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 730 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  24.63 
 
 		 724 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 729 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 727 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0023  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 747 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 727 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 657 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 656 aa  108  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 773 aa  106  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 709 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.94 
 
 		 726 aa  105  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 827 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  23.79 
 
 		 666 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  21.21 
 
 		 764 aa  98.6  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 728 aa  98.2  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 738 aa  98.2  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  24.8 
 
 		 707 aa  95.9  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  23.45 
 
 		 659 aa  95.9  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  24.69 
 
 		 737 aa  95.9  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.77 
 
 		 706 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 690 aa  95.5  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.77 
 
 		 706 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.77 
 
 		 721 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.63 
 
 		 706 aa  94.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 653 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.77 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  22.69 
 
 		 696 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3644  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 653 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  22.5 
 
 		 696 aa  93.2  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  22.91 
 
 		 706 aa  92.8  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  22.77 
 
 		 696 aa  93.2  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  23.28 
 
 		 708 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  24.37 
 
 		 696 aa  92  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  22.5 
 
 		 698 aa  92.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  25 
 
 		 689 aa  92  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  22.46 
 
 		 690 aa  91.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 699 aa  90.5  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 705 aa  90.5  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 734 aa  90.5  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 736 aa  90.5  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3767  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 653 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 638 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  28.57 
 
 		 653 aa  89.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0663  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 652 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  22.88 
 
 		 713 aa  89.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 653 aa  89.7  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  22.36 
 
 		 696 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  23.07 
 
 		 721 aa  88.6  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 706 aa  89  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 		 701 aa  89  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 719 aa  89  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 708 aa  88.6  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  23.55 
 
 		 793 aa  88.2  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.27 
 
 		 713 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 810 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 653 aa  87.8  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  26.97 
 
 		 713 aa  87.4  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>