152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05857 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  85.92 
 
 		 1130 aa  2045    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  100 
 
 		 1129 aa  2325    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  24.37 
 
 		 1177 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  24.37 
 
 		 1177 aa  292  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  23.49 
 
 		 1187 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  23.48 
 
 		 1182 aa  279  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1174 aa  279  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1174 aa  278  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1153 aa  273  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  22.49 
 
 		 1153 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  23.82 
 
 		 1194 aa  271  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1008 aa  262  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1208 aa  251  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  23.73 
 
 		 1179 aa  250  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  22.88 
 
 		 1165 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  22.08 
 
 		 1165 aa  244  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.98 
 
 		 1165 aa  241  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  22.85 
 
 		 1199 aa  240  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  22.65 
 
 		 1194 aa  239  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  21.4 
 
 		 1172 aa  235  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1206 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1192 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  22.65 
 
 		 1206 aa  231  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  21.01 
 
 		 1176 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  21.96 
 
 		 1171 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  22.59 
 
 		 1209 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  22.59 
 
 		 1209 aa  214  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  22.59 
 
 		 1209 aa  214  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  22.59 
 
 		 1209 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  22.59 
 
 		 1209 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  22.59 
 
 		 1209 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  22.59 
 
 		 1209 aa  213  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1102 aa  212  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  22.75 
 
 		 1209 aa  211  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1179 aa  209  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  23.29 
 
 		 1302 aa  204  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  23.29 
 
 		 1302 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  23.2 
 
 		 1302 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1168 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1208 aa  201  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1175 aa  199  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1175 aa  199  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  23.04 
 
 		 1220 aa  194  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  21.36 
 
 		 1182 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  22.78 
 
 		 1152 aa  190  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  22.07 
 
 		 1302 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  22.46 
 
 		 1176 aa  185  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1205 aa  184  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  22.52 
 
 		 1212 aa  184  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  21.87 
 
 		 1302 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  23.54 
 
 		 1205 aa  174  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  23.07 
 
 		 1207 aa  172  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  22.98 
 
 		 1173 aa  171  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  22.46 
 
 		 1204 aa  171  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  21.4 
 
 		 1157 aa  171  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1173 aa  170  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  21.89 
 
 		 1209 aa  164  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  20.55 
 
 		 1181 aa  161  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  22.07 
 
 		 1218 aa  161  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  22.48 
 
 		 1317 aa  158  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  25.26 
 
 		 1302 aa  151  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1369 aa  145  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  21.37 
 
 		 1181 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  21.31 
 
 		 1365 aa  136  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  22.55 
 
 		 1348 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  24.07 
 
 		 1268 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  22.57 
 
 		 1366 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  20.91 
 
 		 1148 aa  131  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  20.38 
 
 		 1288 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  23.4 
 
 		 1175 aa  127  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  19.37 
 
 		 1195 aa  127  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1332 aa  125  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  24.9 
 
 		 973 aa  124  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  24.9 
 
 		 973 aa  123  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  20.69 
 
 		 1164 aa  113  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  23.3 
 
 		 1164 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1147 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1104 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  23.21 
 
 		 728 aa  110  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1167 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1167 aa  110  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1167 aa  110  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1167 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1164 aa  104  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  24.07 
 
 		 1164 aa  103  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  20.74 
 
 		 1275 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  22.34 
 
 		 1329 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  20.74 
 
 		 1275 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  22.07 
 
 		 1358 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  22.46 
 
 		 1358 aa  98.2  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  22.46 
 
 		 1358 aa  97.8  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  20.54 
 
 		 1270 aa  91.3  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1315 aa  90.1  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  22.05 
 
 		 1365 aa  89.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  24.2 
 
 		 1301 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  24.19 
 
 		 1315 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  24.47 
 
 		 1313 aa  84.7  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1798  ImcF domain-containing protein  19.96 
 
 		 1067 aa  84.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  24.47 
 
 		 1313 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  25.82 
 
 		 431 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>