More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003896 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 545 aa  1090    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  77.43 
 
 		 545 aa  835    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  51.76 
 
 		 546 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.24 
 
 		 638 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 543 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 543 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 543 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 		 645 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.08 
 
 		 543 aa  263  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  43.1 
 
 		 559 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 543 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 543 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.71 
 
 		 712 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 543 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 		 554 aa  256  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  41.44 
 
 		 712 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 		 713 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 543 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 		 497 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 		 637 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 		 674 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 		 634 aa  249  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.64 
 
 		 716 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 		 645 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 645 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 544 aa  247  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.93 
 
 		 637 aa  247  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  43.52 
 
 		 634 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 		 702 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.55 
 
 		 645 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.52 
 
 		 643 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 568 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.55 
 
 		 645 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.1 
 
 		 634 aa  243  9e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  41.46 
 
 		 558 aa  243  9e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  42.43 
 
 		 560 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 		 627 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 		 545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  42.42 
 
 		 561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  42.42 
 
 		 561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 640 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.2 
 
 		 546 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  41.21 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  39.32 
 
 		 623 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.32 
 
 		 636 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  41.88 
 
 		 639 aa  232  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  39.6 
 
 		 623 aa  232  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.83 
 
 		 564 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 548 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  39.18 
 
 		 558 aa  231  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 548 aa  231  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  41.81 
 
 		 628 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.38 
 
 		 545 aa  230  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 		 638 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 573 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 548 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 		 636 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  38.31 
 
 		 632 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.03 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  39.22 
 
 		 554 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  38.31 
 
 		 632 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.24 
 
 		 638 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.09 
 
 		 555 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  41.38 
 
 		 628 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  39.66 
 
 		 553 aa  227  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  40.57 
 
 		 553 aa  227  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.42 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  41.95 
 
 		 545 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 495 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 632 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 495 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 495 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 		 495 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.4 
 
 		 541 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 		 640 aa  226  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.6 
 
 		 555 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.57 
 
 		 411 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  37.03 
 
 		 629 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.15 
 
 		 638 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 		 554 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.03 
 
 		 554 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.54 
 
 		 714 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 		 714 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  39.48 
 
 		 714 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 		 554 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.81 
 
 		 541 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  36.76 
 
 		 629 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 		 572 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 		 715 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 		 714 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.06 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>