209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2399 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  100 
 
 
241 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  49.59 
 
 
261 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  50.41 
 
 
269 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  48.56 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  48.82 
 
 
255 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  45.9 
 
 
261 aa  158  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  44.21 
 
 
265 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  41.32 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  43.57 
 
 
275 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  47.08 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  41.15 
 
 
304 aa  138  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  41.95 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  41.95 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  43.21 
 
 
279 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  38.75 
 
 
257 aa  124  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.45 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.93 
 
 
268 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  40 
 
 
274 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  38.25 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  41.63 
 
 
244 aa  108  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  43.41 
 
 
261 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  41.06 
 
 
262 aa  106  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  42.8 
 
 
257 aa  105  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.96 
 
 
259 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.13 
 
 
264 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  39.41 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.76 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  43.27 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.27 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  38.98 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  31.19 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
375 aa  78.6  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.95 
 
 
356 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 
360 aa  75.1  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.75 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  38.65 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  27 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1381  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000108587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1408  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0360558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.96 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  29.9 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 
306 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  23.62 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  26.29 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  23.62 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3543  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187999  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  23.62 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  23.12 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  23.12 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  22.61 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  22.61 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 
370 aa  58.9  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  23.72 
 
 
325 aa  58.9  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  22.48 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  22.11 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  30.54 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 
252 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  28.67 
 
 
373 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
336 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.4 
 
 
327 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  26.69 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  27.69 
 
 
640 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 
262 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
281 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  25.79 
 
 
284 aa  52.8  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
265 aa  52.4  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  32.47 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 
263 aa  52.4  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.67 
 
 
255 aa  52.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
256 aa  52  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.32 
 
 
232 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  24.14 
 
 
356 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  24.14 
 
 
374 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  27.49 
 
 
376 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 
279 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 
367 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 
272 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.27 
 
 
254 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.35 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>