More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1735 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  75.13 
 
 		 596 aa  908    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  74.25 
 
 		 602 aa  942    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  100 
 
 		 604 aa  1222    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  75.58 
 
 		 604 aa  962    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  51.63 
 
 		 610 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  47.44 
 
 		 631 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  35.11 
 
 		 855 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  35.46 
 
 		 780 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  36.01 
 
 		 702 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  33.81 
 
 		 843 aa  303  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 744 aa  300  6e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  34.48 
 
 		 844 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  31.87 
 
 		 849 aa  294  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  34.97 
 
 		 931 aa  294  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  32.45 
 
 		 771 aa  293  9e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  31.27 
 
 		 837 aa  291  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  33.93 
 
 		 827 aa  289  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  32.19 
 
 		 747 aa  289  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 863 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  33.95 
 
 		 931 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  31.91 
 
 		 837 aa  282  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  33.18 
 
 		 864 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  34.18 
 
 		 942 aa  280  4e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  30.81 
 
 		 743 aa  277  4e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8810  DNA topoisomerase  31.01 
 
 		 868 aa  271  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.917921  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  32.24 
 
 		 834 aa  271  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  32.94 
 
 		 935 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34564  DNA topoisomerase  32 
 
 		 616 aa  266  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  32.66 
 
 		 938 aa  262  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32265  predicted protein  32.26 
 
 		 863 aa  259  8e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142978  normal  0.982566 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33842  predicted protein  33.83 
 
 		 641 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00400  DNA topoisomerase type I, putative  29.92 
 
 		 828 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772015  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47417  predicted protein  34.01 
 
 		 1009 aa  253  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04555  DNA topoisomerase III (Eurofung)  30.5 
 
 		 629 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.755081  normal  0.215917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  27 
 
 		 812 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  27.42 
 
 		 817 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  26.68 
 
 		 814 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  27.96 
 
 		 853 aa  216  8e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  26.19 
 
 		 814 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  27.04 
 
 		 668 aa  189  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  28.74 
 
 		 868 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 869 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.65 
 
 		 869 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 869 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 869 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 884 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 892 aa  182  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  27.21 
 
 		 896 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 751 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  26.25 
 
 		 689 aa  177  7e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  27.49 
 
 		 691 aa  176  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  27.49 
 
 		 691 aa  176  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  28.93 
 
 		 868 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  28.98 
 
 		 868 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  28.93 
 
 		 868 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  28.1 
 
 		 868 aa  171  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  25.78 
 
 		 695 aa  169  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  28.6 
 
 		 872 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 889 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  28.98 
 
 		 876 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  28.48 
 
 		 870 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  27.87 
 
 		 895 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 894 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 894 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 895 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 696 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1803  DNA topoisomerase I  29.45 
 
 		 906 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0789615  hitchhiker  0.0000387309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 868 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 878 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  26.42 
 
 		 700 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 879 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 898 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  27.9 
 
 		 869 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  25.93 
 
 		 700 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2520  DNA topoisomerase III  28.07 
 
 		 697 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 894 aa  163  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  27.63 
 
 		 747 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 697 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  26.36 
 
 		 760 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  25.76 
 
 		 743 aa  161  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 886 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 866 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  28.49 
 
 		 867 aa  161  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  24.67 
 
 		 706 aa  160  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1535  DNA topoisomerase I  28.27 
 
 		 896 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  26.25 
 
 		 691 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  26.04 
 
 		 758 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  28.6 
 
 		 880 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  28.17 
 
 		 866 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  26.93 
 
 		 633 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  25.27 
 
 		 693 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  25.69 
 
 		 700 aa  159  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  28.2 
 
 		 865 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  26.23 
 
 		 695 aa  159  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  28.2 
 
 		 865 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  28.66 
 
 		 877 aa  159  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  28.6 
 
 		 880 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  28.6 
 
 		 880 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  28.2 
 
 		 865 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  28.2 
 
 		 865 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>