More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2693 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2693  type II and III secretion system protein  100 
 
 
479 aa  943  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000595981  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  42.32 
 
 
714 aa  304  3e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  36.6 
 
 
443 aa  241  3e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  32.53 
 
 
436 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  32.84 
 
 
436 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2920  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  34.17 
 
 
595 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4345  type II and III secretion system protein  35.07 
 
 
451 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222675  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6875  type II and III secretion system protein  32.37 
 
 
561 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.52559  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0707  putative type II and III secretion system outermembrane protein, secretin  31.81 
 
 
423 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.848525  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  29.45 
 
 
482 aa  165  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  29.83 
 
 
477 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2117  type II and III secretion system protein  30.52 
 
 
356 aa  156  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  29.59 
 
 
484 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  30.8 
 
 
490 aa  154  3e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  32.78 
 
 
483 aa  154  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  28.15 
 
 
493 aa  149  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  33.75 
 
 
460 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  32.85 
 
 
460 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  29.72 
 
 
469 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  32.69 
 
 
460 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  31.34 
 
 
484 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  31.34 
 
 
487 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  29.38 
 
 
473 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  29.81 
 
 
422 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  31.49 
 
 
444 aa  140  4e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  30.95 
 
 
461 aa  140  5e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  30.85 
 
 
453 aa  140  5e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  30.86 
 
 
454 aa  140  5e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  31.79 
 
 
495 aa  140  5e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  30.95 
 
 
461 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  30.45 
 
 
454 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  28.16 
 
 
492 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  29.92 
 
 
464 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  30.45 
 
 
454 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2704  type II/III secretion system protein  31.54 
 
 
478 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2326  type II and III secretion system protein  31.54 
 
 
478 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434108  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  29.26 
 
 
517 aa  136  1e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  31.13 
 
 
497 aa  135  1e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  31.39 
 
 
443 aa  135  2e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.94738e-06  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  30.16 
 
 
461 aa  135  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  30.22 
 
 
468 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  31.28 
 
 
443 aa  134  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  4.30206e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  30.48 
 
 
443 aa  133  7e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  3.7114e-06 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  30.48 
 
 
443 aa  133  7e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  30.48 
 
 
443 aa  133  7e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  32.23 
 
 
441 aa  132  1e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  32.24 
 
 
496 aa  132  2e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  35.07 
 
 
479 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  28.28 
 
 
466 aa  131  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  29.4 
 
 
454 aa  130  4e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  29.78 
 
 
408 aa  130  4e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  29.18 
 
 
526 aa  130  5e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  29.89 
 
 
473 aa  130  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  30.6 
 
 
461 aa  129  8e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  29.25 
 
 
501 aa  129  9e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  26.81 
 
 
479 aa  129  9e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  30.15 
 
 
474 aa  129  1e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  30.18 
 
 
461 aa  129  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  31.73 
 
 
432 aa  128  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  31.73 
 
 
432 aa  128  2e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  31.73 
 
 
432 aa  128  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  30.9 
 
 
419 aa  129  2e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  27.78 
 
 
480 aa  129  2e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  31.73 
 
 
441 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  31.73 
 
 
441 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  31.43 
 
 
428 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  31.73 
 
 
441 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  31.73 
 
 
441 aa  128  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  27.63 
 
 
455 aa  127  4e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  27.43 
 
 
514 aa  127  4e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  29.05 
 
 
530 aa  127  4e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  29.78 
 
 
492 aa  127  4e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  30.12 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  30.12 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  30.12 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  30.12 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  30.12 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  30.12 
 
 
482 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  28.3 
 
 
480 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  29.33 
 
 
502 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  27.16 
 
 
466 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  27.74 
 
 
497 aa  127  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  28.64 
 
 
539 aa  126  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  26.87 
 
 
489 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  26.61 
 
 
482 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  29.07 
 
 
502 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  34.89 
 
 
416 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  30.98 
 
 
451 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  32.01 
 
 
451 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  29.3 
 
 
419 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  26.96 
 
 
486 aa  123  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  28.23 
 
 
499 aa  122  1e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  33.47 
 
 
416 aa  122  1e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  28.48 
 
 
494 aa  122  2e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  28.21 
 
 
633 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  29.02 
 
 
491 aa  120  4e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  28.22 
 
 
571 aa  120  5e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  32.55 
 
 
457 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  27.86 
 
 
663 aa  119  1e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  27.86 
 
 
493 aa  119  1e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>