More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2784 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  100 
 
 		 339 aa  680    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  36.34 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1891  porin  35.16 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0840152  normal  0.0627255 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  34.33 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  31.98 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2793  porin  31.46 
 
 		 350 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  29.87 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  31.01 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2038  porin  32.06 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  30.79 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  32.87 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  29.01 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  31.03 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  28.65 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0822  porin  31.3 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  29 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  27.68 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  26.69 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  27.86 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  29.31 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  28.53 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  28.04 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  27.67 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  27.03 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  28.19 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  28.19 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  28.98 
 
 		 338 aa  95.9  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  29.78 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  27.3 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  27.66 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  29.23 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  26.24 
 
 		 342 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  24.4 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  27.47 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  30.56 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  26.63 
 
 		 371 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  29.25 
 
 		 352 aa  91.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  28.9 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  28.61 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  27.48 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  28.61 
 
 		 346 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  28.7 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  27.15 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  25.89 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  28.77 
 
 		 394 aa  89.4  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  27.15 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  29.61 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  29.38 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  29.53 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  24.73 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  24.35 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  28.87 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  27.3 
 
 		 313 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  27.3 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  25.9 
 
 		 316 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  29.24 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  29.08 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  27.04 
 
 		 384 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  27.12 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  26.13 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  28.78 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  27.14 
 
 		 335 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  26.24 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  26.53 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  24.77 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  27.73 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  29.54 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  24.77 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  27.19 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  23.9 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  29.19 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  26.99 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  30.63 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  27.04 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  27.41 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  28.26 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  26.45 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  30.74 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  27.4 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  28.15 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  27.86 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  28.83 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  27.27 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0773  outer membrane protein (porin)  26.4 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000136886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  27.16 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  31.38 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  28.26 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  27.73 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  33.18 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  25 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  25.48 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  26.57 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  33.18 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  33.18 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  33.18 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  33.18 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  33.18 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  27.57 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  33.18 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.21 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>