More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0900 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 
244 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  56.56 
 
 
244 aa  311  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  55.92 
 
 
245 aa  290  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  52.46 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  53.28 
 
 
246 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  53.28 
 
 
246 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  52.05 
 
 
245 aa  255  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  49.59 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  49.59 
 
 
244 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  47.77 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  47.13 
 
 
252 aa  240  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  46.37 
 
 
248 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  46.37 
 
 
248 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  43.85 
 
 
244 aa  234  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  43.85 
 
 
264 aa  232  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  45.53 
 
 
246 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  44.13 
 
 
250 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  43.03 
 
 
259 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  44.26 
 
 
249 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  44.49 
 
 
261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  45.9 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  43.75 
 
 
245 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  45.93 
 
 
250 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  45.31 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 
247 aa  215  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 
252 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  43.27 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
245 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  42.92 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  40.57 
 
 
244 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  39.34 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  38.93 
 
 
262 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  42.5 
 
 
245 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  40.57 
 
 
271 aa  209  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1729  tRNA pseudouridine synthase A  41.77 
 
 
271 aa  207  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0992895  hitchhiker  0.00555362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2071  tRNA pseudouridine synthase A  41.77 
 
 
271 aa  207  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.179151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  39.75 
 
 
244 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  39.09 
 
 
266 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1560  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 
302 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.949883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1931  tRNA pseudouridine synthase A  39.24 
 
 
302 aa  203  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797555  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0801  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
262 aa  202  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0247033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  41.08 
 
 
263 aa  202  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  40.57 
 
 
248 aa  201  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  40.82 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  39.24 
 
 
259 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  42.74 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  41.18 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  38.27 
 
 
271 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 
247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  38.59 
 
 
283 aa  195  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  41.22 
 
 
252 aa  195  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  40.74 
 
 
261 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  42.04 
 
 
252 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 
261 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  42.32 
 
 
245 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1626  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 
268 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.895885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1914  tRNA pseudouridine synthase A  37.76 
 
 
351 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.73 
 
 
270 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0263  tRNA pseudouridine synthase A  39.18 
 
 
246 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3064  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 
265 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  44.44 
 
 
264 aa  193  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1130  tRNA pseudouridine synthase A  38.78 
 
 
248 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.131343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 
245 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  37.74 
 
 
305 aa  192  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  43.5 
 
 
244 aa  192  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  39.43 
 
 
259 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 
261 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1068  tRNA pseudouridine synthase A  43.15 
 
 
245 aa  191  7e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17411  tRNA pseudouridine synthase A  40.65 
 
 
268 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 
261 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  39.59 
 
 
245 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 
264 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3148  tRNA pseudouridine synthase A  38.52 
 
 
253 aa  191  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733437  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2585  tRNA pseudouridine synthase A  40.33 
 
 
275 aa  191  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0717  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
282 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000371927  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  40.87 
 
 
264 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  41.25 
 
 
258 aa  190  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  39.42 
 
 
261 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 
252 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  41.15 
 
 
261 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3303  tRNA pseudouridine synthase A  39.58 
 
 
245 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0316618  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  39 
 
 
261 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1234  tRNA pseudouridine synthase A  38.4 
 
 
261 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.512181  normal  0.233712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0540  tRNA pseudouridine synthase A  40.5 
 
 
259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.999285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>