192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1797 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
197 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  57.29 
 
 
188 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  54.87 
 
 
197 aa  194  8e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  56.91 
 
 
212 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  52.82 
 
 
197 aa  173  2e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  49.74 
 
 
208 aa  163  2e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  51.3 
 
 
192 aa  162  4e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  49.25 
 
 
200 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 
205 aa  157  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  51.41 
 
 
279 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  47.64 
 
 
200 aa  144  8e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
191 aa  126  2e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
208 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
192 aa  115  4e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  37.23 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  42.5 
 
 
189 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21459e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 
200 aa  79  4e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
227 aa  69.7  2e-11  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
233 aa  68.6  6e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
210 aa  66.2  3e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
210 aa  66.2  3e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
210 aa  66.2  3e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
195 aa  64.3  1e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
197 aa  62.8  3e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
197 aa  62.8  3e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
197 aa  62.8  3e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
195 aa  62.4  4e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
197 aa  62.4  5e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 
229 aa  61.6  7e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  59.3  3e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.85 
 
 
232 aa  59.7  3e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
196 aa  59.7  3e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
197 aa  57.4  1e-07  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 
193 aa  55.8  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 
239 aa  55.5  5e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
209 aa  55.1  7e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
193 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
193 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
194 aa  53.9  2e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
193 aa  53.5  2e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 
223 aa  53.1  3e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
204 aa  52  5e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  39.39 
 
 
207 aa  52.4  5e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
198 aa  50.8  1e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
198 aa  50.8  1e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
198 aa  50.8  1e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
211 aa  50.1  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 
195 aa  50.1  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
197 aa  50.4  2e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
213 aa  49.7  3e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  31.48 
 
 
208 aa  49.7  3e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
237 aa  49.3  4e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
255 aa  48.1  7e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
203 aa  48.1  8e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 
199 aa  48.1  9e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
216 aa  48.1  9e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 
192 aa  48.1  9e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
225 aa  47.8  9e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  38.82 
 
 
192 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 
219 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
199 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  42.31 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
183 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  41.38 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
214 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 
201 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
217 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 
205 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
212 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.32236e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  36.11 
 
 
223 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  6.67757e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  34.07 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
218 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  38.98 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>